More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2398 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
531 aa  1069    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40 
 
 
514 aa  243  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  31.65 
 
 
629 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.31 
 
 
578 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.93 
 
 
621 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  34.31 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  33.82 
 
 
404 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  31.84 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1311  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.72 
 
 
386 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3157  hypothetical protein  32.85 
 
 
405 aa  73.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.842057  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.15 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  29.91 
 
 
502 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  33.52 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  31.11 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  33.86 
 
 
379 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2025  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.11 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.591638  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.76 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.34 
 
 
381 aa  66.6  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0850  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.74 
 
 
475 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0856  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.74 
 
 
475 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0867  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.74 
 
 
475 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  30.77 
 
 
501 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  30.26 
 
 
528 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.27 
 
 
497 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 
501 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.8 
 
 
501 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  32.8 
 
 
382 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.58 
 
 
377 aa  64.7  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  35.19 
 
 
480 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  30.77 
 
 
500 aa  63.9  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0467  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
497 aa  63.9  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  28.36 
 
 
772 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  32.1 
 
 
373 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.65 
 
 
383 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0936  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.63 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  30.22 
 
 
401 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  31.91 
 
 
537 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.98 
 
 
481 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1938  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.91 
 
 
377 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  33.55 
 
 
528 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.67 
 
 
506 aa  61.6  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  36.99 
 
 
383 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.12 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  36.99 
 
 
383 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5537  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.73 
 
 
335 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  35.63 
 
 
374 aa  61.6  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  31.53 
 
 
399 aa  61.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.73 
 
 
512 aa  61.6  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.09 
 
 
392 aa  61.2  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  35.44 
 
 
501 aa  61.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  27.8 
 
 
467 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  31 
 
 
397 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.66 
 
 
341 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.99 
 
 
384 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.66 
 
 
341 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  36.11 
 
 
361 aa  60.8  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.66 
 
 
341 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  34.27 
 
 
360 aa  60.5  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  31.68 
 
 
370 aa  60.5  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  36.49 
 
 
383 aa  60.5  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  36.3 
 
 
384 aa  60.5  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  30.73 
 
 
487 aa  60.5  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.84 
 
 
389 aa  60.5  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  26.92 
 
 
459 aa  60.5  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  33.73 
 
 
359 aa  60.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0037  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.91 
 
 
307 aa  60.1  0.00000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.2 
 
 
352 aa  60.1  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  32.32 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  32.32 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  32.97 
 
 
344 aa  59.7  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  34.34 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.62 
 
 
674 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.81 
 
 
428 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  32.32 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0731  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.22 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.415998  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  32.7 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  26.92 
 
 
442 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  32.32 
 
 
360 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  29.63 
 
 
501 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  30.33 
 
 
397 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  29.91 
 
 
397 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  34.19 
 
 
323 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  36.73 
 
 
365 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  36.99 
 
 
374 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  31.48 
 
 
357 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 
372 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  32.95 
 
 
348 aa  59.3  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  36.09 
 
 
376 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  33.12 
 
 
499 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  29.1 
 
 
496 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  33.73 
 
 
368 aa  58.9  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  33.14 
 
 
356 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  33.12 
 
 
393 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  33.1 
 
 
360 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3599  periplasmic serine protease DegS  34.03 
 
 
360 aa  58.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  36.11 
 
 
361 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32 
 
 
388 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  33.1 
 
 
360 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  33.1 
 
 
360 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  33.1 
 
 
360 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>