More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1988 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
395 aa  763    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  51.79 
 
 
392 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.16 
 
 
392 aa  343  4e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.7 
 
 
393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  45.67 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  47.51 
 
 
402 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.09 
 
 
392 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  51.84 
 
 
394 aa  296  3e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.62 
 
 
392 aa  296  4e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  43.42 
 
 
399 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  43.57 
 
 
394 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  45.15 
 
 
393 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  41.13 
 
 
397 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  41.19 
 
 
395 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  41.19 
 
 
395 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  41.19 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  39.54 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.47 
 
 
397 aa  252  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  44.56 
 
 
399 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  42.46 
 
 
397 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.71 
 
 
391 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  40.5 
 
 
401 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  39.85 
 
 
395 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.69 
 
 
402 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  41.62 
 
 
397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.16 
 
 
394 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  38.28 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  37.6 
 
 
394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.69 
 
 
394 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.52 
 
 
389 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.49 
 
 
432 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  34.08 
 
 
383 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  36.36 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  34.72 
 
 
383 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  34.25 
 
 
357 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  34.25 
 
 
373 aa  67  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  38.61 
 
 
495 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  33.49 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  35.68 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 
375 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  31.91 
 
 
368 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  32.12 
 
 
382 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  31.25 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  35.66 
 
 
492 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  35.66 
 
 
477 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  35.42 
 
 
373 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  35.66 
 
 
479 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  34.97 
 
 
481 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.1 
 
 
476 aa  63.2  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.67 
 
 
296 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  34.27 
 
 
479 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  31.21 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  34.97 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  38.1 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  35.95 
 
 
491 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  36.31 
 
 
344 aa  62.4  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  33.73 
 
 
351 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  36.62 
 
 
494 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.71 
 
 
363 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  29.89 
 
 
247 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.11 
 
 
752 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  32.32 
 
 
474 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  36.36 
 
 
497 aa  61.2  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  35.66 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.66 
 
 
389 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.97 
 
 
477 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.71 
 
 
474 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.76 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  38.19 
 
 
478 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3659  2-alkenal reductase  37.16 
 
 
341 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149627  normal  0.297116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.06 
 
 
481 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.71 
 
 
483 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1619  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.09 
 
 
242 aa  60.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.527174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  33.57 
 
 
487 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35.66 
 
 
473 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.06 
 
 
484 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  33.1 
 
 
490 aa  60.1  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.95 
 
 
552 aa  60.1  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  34.84 
 
 
473 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  26.15 
 
 
264 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  35.33 
 
 
520 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  32.94 
 
 
308 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.04 
 
 
428 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  37.32 
 
 
500 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  32.87 
 
 
482 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
399 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  33.1 
 
 
476 aa  59.3  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.7 
 
 
377 aa  59.7  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  30.99 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  36.62 
 
 
493 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  33.7 
 
 
494 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  36.62 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1127  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.58 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0664983  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 
426 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  33.57 
 
 
483 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  34.03 
 
 
469 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  37.32 
 
 
494 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2063  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.49 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239523  hitchhiker  0.000119694 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  36.62 
 
 
493 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  35.88 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>