More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8860 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  100 
 
 		 393 aa  779    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.94 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  44.42 
 
 		 392 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.64 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  47.76 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  43.86 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  45.71 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.6 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  44.79 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.55 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  42.09 
 
 		 397 aa  285  8e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.84 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  40.97 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  46.44 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.69 
 
 		 394 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  37.4 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  38.76 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  39.49 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  40.41 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.69 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  39.26 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  39.26 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  39.26 
 
 		 395 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  39.17 
 
 		 397 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.68 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  41.43 
 
 		 397 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  36.24 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  35.68 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  32.37 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.92 
 
 		 394 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.44 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  26.86 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  35.86 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  35.86 
 
 		 357 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  35.17 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  32.1 
 
 		 442 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.54 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  31.84 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.75 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.57 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  34.19 
 
 		 495 aa  67  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1619  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.93 
 
 		 242 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.527174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.14 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  32.41 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  32.89 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  29.7 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0500  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.71 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  33.72 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.29 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  30.18 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  33.56 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0558  DegP2 peptidase  32.53 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  31.29 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  34.55 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.12 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  32.39 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  30.95 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  31.58 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  30.34 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  30.34 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  31.28 
 
 		 483 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  37.41 
 
 		 487 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  32.21 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  34.04 
 
 		 351 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  31.4 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.54 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.06 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  32.4 
 
 		 352 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  31.28 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  32.89 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  32.45 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.22 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  35.21 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0935  2-alkenal reductase  31.18 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000784268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  34.75 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  29.57 
 
 		 375 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4415  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  33.1 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.48 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  30 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0845  peptidase S1  34.53 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  30 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  30 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  30.14 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  30 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.05 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  30 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  31.91 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  30 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  35.46 
 
 		 520 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  32.14 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  30 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  31.14 
 
 		 476 aa  60.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  30.38 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  30 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  30.38 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  30 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  29.3 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  31.94 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>