More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0420 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 402 aa  753    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  43.29 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  43.83 
 
 		 393 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.56 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.06 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  39.79 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  38.95 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.52 
 
 		 392 aa  235  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  39.55 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  39.55 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  39.55 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.84 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.21 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  37.28 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  39.95 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  37.78 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.52 
 
 		 393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  39.65 
 
 		 397 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  39.55 
 
 		 393 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  38.48 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  37.97 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  38 
 
 		 395 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  36.22 
 
 		 394 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.21 
 
 		 394 aa  206  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  41.56 
 
 		 394 aa  205  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.11 
 
 		 391 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  39.31 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  36.54 
 
 		 397 aa  176  7e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.18 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  35.86 
 
 		 398 aa  166  5e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.09 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  34.85 
 
 		 383 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.08 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  32.16 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2439  trypsin-like serine protease  35.71 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0015948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  31.28 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  36.13 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1946  trypsin-like serine protease  32.92 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  33.51 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.67 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.14 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3708  serine protease HtrA  33.33 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2917  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.18 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  32.28 
 
 		 503 aa  68.6  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3357  serine protease  32.7 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000249985  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3307  serine protease  32.7 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0235916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3287  2-alkenal reductase  32.7 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266575  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  32.9 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3611  serine protease HtrA  32.7 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.83857e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1607  serine protease HtrA  32.7 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000329826  hitchhiker  0.000000000234039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3395  serine protease  32.08 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0740174  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.89 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3660  serine protease  32.08 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590944  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  28.97 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2202  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.03 
 
 		 497 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.718376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  35.57 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  32.11 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3626  serine protease HtrA  32.08 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000566135  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  35.57 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3619  serine protease  32.08 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000616865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  30.17 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  32.02 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2249  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000589129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.76 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.36 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.73 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  30.86 
 
 		 476 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.31 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  33.12 
 
 		 497 aa  64.3  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.95 
 
 		 375 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.09 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  32.16 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.34 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  32.68 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  30.94 
 
 		 389 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.78 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  30.94 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0024  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  32.69 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  30.46 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  34.87 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  31.66 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0107  trypsin-like serine protease  33.13 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  31.82 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2174  serine protease  31.58 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00156367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.42 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  35.29 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  31.03 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  34.23 
 
 		 373 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.51 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  34.76 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  32.05 
 
 		 474 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  32.69 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  35.5 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1879  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.16 
 
 		 318 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4494  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.98 
 
 		 496 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.18457  normal  0.102663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>