More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2705 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 414 aa  848    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  86.08 
 
 		 388 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  46.22 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.15 
 
 		 513 aa  172  9e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1261  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.38 
 
 		 485 aa  160  3e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  45.41 
 
 		 855 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3400  trypsin-like serine protease  38.64 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0421  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.18 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.21 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.38 
 
 		 453 aa  97.1  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.37 
 
 		 337 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  34.07 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  32.2 
 
 		 379 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.84 
 
 		 464 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  41.45 
 
 		 498 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  41.46 
 
 		 469 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  33.16 
 
 		 478 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  38.82 
 
 		 453 aa  87  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  34.29 
 
 		 474 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  32.96 
 
 		 491 aa  86.7  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  35.33 
 
 		 476 aa  86.7  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  34.67 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  34.09 
 
 		 464 aa  86.3  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  37.1 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.22 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  31.66 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  31.98 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  37.8 
 
 		 524 aa  85.5  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  32.98 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  33.18 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.29 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  32.14 
 
 		 501 aa  84.3  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  40.27 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  32.32 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  38.56 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  33.18 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  33.17 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  33.64 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0641  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.757288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  31.31 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.51 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.79 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  33.95 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0504  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1855  hypothetical protein  28.57 
 
 		 593 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  40.67 
 
 		 498 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  36.96 
 
 		 485 aa  82.8  0.000000000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  34.59 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  34.62 
 
 		 497 aa  82.4  0.00000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  30.81 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  37.33 
 
 		 525 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  32.39 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  37.5 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  36.96 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.79 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  33 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  31.9 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  35.68 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  35.68 
 
 		 524 aa  81.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4901  HtrA2 peptidase  38.56 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  38.22 
 
 		 508 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  36.3 
 
 		 500 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1750  2-alkenal reductase  32.8 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137948  normal  0.435495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  35.26 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  31.31 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  32.62 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  37.09 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 499 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  30.92 
 
 		 501 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  35.76 
 
 		 473 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  32.8 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2015  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.92393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  34.69 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  37.93 
 
 		 501 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  35.68 
 
 		 520 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  36.73 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  36.42 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  31.28 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  36.42 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  38.78 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  36.67 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.96 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  31.55 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  38.78 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  31.55 
 
 		 459 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0353  trypsin-like serine protease  33.13 
 
 		 583 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.326819  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0731  peptidase S1C, Do  35.17 
 
 		 467 aa  78.6  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000553018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  30.73 
 
 		 502 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  34.23 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2119  2-alkenal reductase  32.97 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  37.59 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  37.04 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  37.93 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  39.73 
 
 		 496 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  33.51 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  34.69 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  30.9 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2313  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1808  trypsin-like serine protease  31.25 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000335064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>