293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0343 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 391 aa  765    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  42.97 
 
 		 392 aa  281  2e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  41.69 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  40.47 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.86 
 
 		 393 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.95 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  40.89 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.15 
 
 		 392 aa  246  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  43.46 
 
 		 394 aa  246  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.44 
 
 		 395 aa  245  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  39.37 
 
 		 402 aa  239  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.8 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.68 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  39.13 
 
 		 397 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  38.62 
 
 		 401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  38.27 
 
 		 393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  36.84 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  36.62 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  37.11 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  35.64 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  36.17 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  36.02 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  36.17 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  36.17 
 
 		 395 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.03 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  37.72 
 
 		 383 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  32.02 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  36.92 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.85 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  32.6 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.9 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0422  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.9 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.90605  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2598  trypsin family protein  30.81 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.7222  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  30 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  32.04 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  32.98 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  27.6 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1370  2-alkenal reductase  32.9 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876764 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  34.27 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  29.88 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  31.88 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  32.74 
 
 		 308 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  35.46 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.34 
 
 		 362 aa  54.3  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  32.92 
 
 		 506 aa  54.3  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0403  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.44 
 
 		 551 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000492986  n/a   
 
 
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  29.49 
 
 		 472 aa  53.9  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  29.41 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  28.57 
 
 		 408 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  36.73 
 
 		 516 aa  53.5  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  29.44 
 
 		 476 aa  53.1  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  34.87 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.06 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  26.58 
 
 		 425 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  31.68 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 368 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.44 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  34.87 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0965  hypothetical protein  27.13 
 
 		 363 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  27.13 
 
 		 363 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  35.1 
 
 		 498 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  26.91 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  31.49 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  29.5 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  29.85 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  29.85 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  32.47 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  29.7 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  32.61 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  33.54 
 
 		 348 aa  51.6  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  31.65 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  33.88 
 
 		 495 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  32.47 
 
 		 389 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  32.47 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.42 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.31 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.54 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  27.35 
 
 		 474 aa  50.4  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.63 
 
 		 357 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  29.88 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  30.99 
 
 		 264 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  30.2 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  29.94 
 
 		 483 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  34.01 
 
 		 417 aa  50.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  28.05 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  30.21 
 
 		 487 aa  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5280  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.88 
 
 		 341 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  28.65 
 
 		 411 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2063  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.67 
 
 		 308 aa  50.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239523  hitchhiker  0.000119694 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  34.9 
 
 		 464 aa  49.7  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.07 
 
 		 506 aa  49.7  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3121  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.55 
 
 		 359 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.118738  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11061  hypothetical protein  29.89 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4575  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.55 
 
 		 375 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4912  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.88 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.899758  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5001  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.88 
 
 		 341 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.51 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>