More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0523 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0523  Colicin V production protein  100 
 
 		 393 aa  763    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4316  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.94 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.156676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4756  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  46.97 
 
 		 392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00204971  hitchhiker  0.00219208 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0120  putative serine protease  41.48 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4899  colicin V production protein  43.2 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.625423  normal  0.0769862 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5200  colicin V production protein  43.2 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000777524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4813  colicin V production protein  43.2 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4846  Colicin V production protein  43.72 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  41.69 
 
 		 393 aa  283  5.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1068  Colicin V production protein  43.88 
 
 		 397 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1376  colicin V production protein  41.65 
 
 		 397 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0302787  normal  0.112476 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5318  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.15 
 
 		 392 aa  282  9e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0323  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  44.09 
 
 		 393 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0613736 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0207  colicin V production protein  41.1 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.258107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.53 
 
 		 395 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  41.07 
 
 		 397 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  42.13 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0472  hypothetical protein  39.63 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.97 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36080  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain protein  40.96 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48254  normal  0.498505 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  41.43 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4292  colicin V production protein  45.79 
 
 		 394 aa  250  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3927  Colicin V production protein  39.03 
 
 		 401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  40.05 
 
 		 399 aa  215  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0343  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.36 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0420  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.12 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521727  normal  0.170322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3394  colicin V production protein  37.21 
 
 		 394 aa  187  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.04 
 
 		 394 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  34.38 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1802  Colicin V production protein  32.49 
 
 		 383 aa  136  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0443  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.75 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18270  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  29.98 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.13889  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.51 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.26 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2063  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.98 
 
 		 308 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239523  hitchhiker  0.000119694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  29.95 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  30.67 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  34.97 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  34.32 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  34.32 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.38 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1098  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.08 
 
 		 245 aa  58.9  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.21329  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.74 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000241562  unclonable  0.000000145022 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.3 
 
 		 752 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4344  2-alkenal reductase  35.37 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0713  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  29.45 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  32.26 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  35.03 
 
 		 506 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  35.03 
 
 		 493 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  35.53 
 
 		 494 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.65 
 
 		 514 aa  56.2  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.78 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  30.07 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  34.19 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.38 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  35.67 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  33.54 
 
 		 424 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  28.19 
 
 		 394 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01021  serine protease  32 
 
 		 383 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.425044  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  26.61 
 
 		 370 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  32.1 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.98 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  30.77 
 
 		 389 aa  54.7  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1599  serine protease, MucD, putative  32.65 
 
 		 504 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.210077  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  27.06 
 
 		 394 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  32.28 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1619  trypsin domain-containing protein  34.29 
 
 		 178 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.03 
 
 		 363 aa  53.9  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  34.21 
 
 		 501 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  32.39 
 
 		 537 aa  53.5  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01061  serine protease  33.11 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.057763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  32.28 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  32.28 
 
 		 479 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  32.43 
 
 		 503 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  31.03 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  35.53 
 
 		 494 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  26.75 
 
 		 442 aa  53.1  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01041  serine protease  33.11 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.741511  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  33.54 
 
 		 495 aa  53.1  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  32.26 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  34.69 
 
 		 498 aa  53.1  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  32.28 
 
 		 477 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  33.54 
 
 		 500 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  34.67 
 
 		 522 aa  53.1  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  32 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  34.01 
 
 		 500 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  31.36 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0094  PDZ/DHR/GLGF  32.89 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0532593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  34.87 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  32.48 
 
 		 473 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  34.97 
 
 		 493 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  33.97 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  30.29 
 
 		 411 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  34.87 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  32.19 
 
 		 528 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  34.48 
 
 		 506 aa  52.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  34.87 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  33.33 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>