More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2284 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2284  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 514 aa  1011    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.65 
 
 		 531 aa  277  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  33.2 
 
 		 402 aa  90.9  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  33.85 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  32.3 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  33.08 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0895  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.693546  normal  0.575051 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 629 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35522  normal  0.114627 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  33.64 
 
 		 389 aa  77  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.46 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0403  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.36 
 
 		 551 aa  75.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000492986  n/a   
 
 
 
NC_011757  Mchl_1966  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.82 
 
 		 578 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  31.88 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36 
 
 		 674 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  34.03 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  34.5 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  29.39 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3157  hypothetical protein  30.11 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.842057  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1311  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.82 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000182  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  31.52 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  35.05 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  32.16 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.77 
 
 		 351 aa  67  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.2 
 
 		 481 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.2 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  29.3 
 
 		 498 aa  67  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.7 
 
 		 483 aa  66.6  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  33.03 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0482  serine protease  25.42 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1379  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.25 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  30.62 
 
 		 511 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  28.15 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  27.9 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  32.95 
 
 		 411 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  31.28 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0793  2-alkenal reductase  32.57 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  32.86 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  32.98 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  31.44 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  29.33 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3992  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  31.44 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4006  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  33.52 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4066  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.22 
 
 		 501 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1285  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  32.82 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0886  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.3 
 
 		 916 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3284  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.16 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.71487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  29.1 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  32.6 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  32.6 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2072  PDZ/DHR/GLGF  31.46 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  33.67 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.18 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  31.09 
 
 		 588 aa  64.7  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  32.6 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  31.58 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2582  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.99 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  31.88 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  31.09 
 
 		 578 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1716  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.99 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.319195 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  31.77 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1284  periplasmic serine protease Do; heat shock protein HtrA  32.82 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  31.4 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  31.61 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.89 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2267  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.41 
 
 		 803 aa  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.489099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  29.92 
 
 		 508 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13702  membrane-associated serine protease  31.06 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0403569 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  32.56 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  30.32 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  30.32 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  30.32 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  30.32 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  30.32 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  28.71 
 
 		 497 aa  62.8  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  30.32 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  30.32 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  30.32 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  27.51 
 
 		 464 aa  63.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  29.84 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.73 
 
 		 377 aa  63.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0970  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1624  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.65 
 
 		 405 aa  63.2  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  35.26 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  31.74 
 
 		 368 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  30.73 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  32.73 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  31.55 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  31.58 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  32.73 
 
 		 481 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1988  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.66 
 
 		 347 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  32.39 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1593  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.49 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421913  normal  0.822638 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  29.95 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  29.41 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  30.73 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>