More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1285 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1285  serine protease  100 
 
 		 394 aa  789    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  92.64 
 
 		 394 aa  691    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  87.06 
 
 		 394 aa  666    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  39.53 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.22 
 
 		 401 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  38.18 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.12 
 
 		 475 aa  186  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.55 
 
 		 384 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.51 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.63 
 
 		 464 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37 
 
 		 381 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  39.24 
 
 		 476 aa  179  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.49 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.38 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.58 
 
 		 387 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  37.85 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.67 
 
 		 476 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  39.86 
 
 		 490 aa  177  4e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  39.86 
 
 		 476 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  35.82 
 
 		 478 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  40.62 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  39.57 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  39.57 
 
 		 477 aa  176  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  39.02 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  39.59 
 
 		 504 aa  176  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.39 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.86 
 
 		 511 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.18 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  38.77 
 
 		 464 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  36.73 
 
 		 425 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  37.98 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.46 
 
 		 493 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  38.49 
 
 		 473 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.65 
 
 		 518 aa  173  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  38.98 
 
 		 483 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  40.58 
 
 		 450 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.84 
 
 		 392 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  39.21 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.94 
 
 		 428 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  38.1 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.32 
 
 		 569 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  34.57 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  39.93 
 
 		 511 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  34.24 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  36.81 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  37.28 
 
 		 506 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.37 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  37.73 
 
 		 487 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  38.52 
 
 		 412 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.64 
 
 		 410 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.63 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.48 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.63 
 
 		 483 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  38.69 
 
 		 488 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  37.37 
 
 		 420 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.99 
 
 		 505 aa  169  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  37.8 
 
 		 513 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  38.58 
 
 		 476 aa  169  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  35.21 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  38.32 
 
 		 516 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  36.89 
 
 		 389 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  37.67 
 
 		 499 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  40 
 
 		 411 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  37.64 
 
 		 458 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  37.67 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  37.81 
 
 		 497 aa  168  2e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.46 
 
 		 415 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  39.34 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  37.67 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  37.1 
 
 		 474 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  38.38 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  38.38 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  38.38 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  36.11 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  38.41 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  40.14 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.43 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  39.19 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.79 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  38.52 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.86 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  31.89 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  38.04 
 
 		 505 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.33 
 
 		 408 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.14 
 
 		 452 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1719  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.11 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000748788  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  39.78 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  39.05 
 
 		 408 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  38.18 
 
 		 502 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  35.91 
 
 		 535 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.37 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  37.07 
 
 		 506 aa  166  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  38.41 
 
 		 487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  36.16 
 
 		 466 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  36.36 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1938  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.59 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  40.88 
 
 		 492 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  40.88 
 
 		 492 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3690  HtrA2 peptidase  39.25 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.104241  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.29 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>