More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1209 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 337 aa  695    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.87 
 
 		 363 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  34.27 
 
 		 482 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  39.39 
 
 		 480 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  37.72 
 
 		 481 aa  99.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.2 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  35.2 
 
 		 509 aa  93.2  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  34.95 
 
 		 492 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  34.73 
 
 		 502 aa  93.2  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  34.95 
 
 		 477 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  34.09 
 
 		 475 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  32.65 
 
 		 464 aa  92.4  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.52 
 
 		 414 aa  92.4  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.14 
 
 		 513 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.8 
 
 		 476 aa  92  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  34.41 
 
 		 477 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  34.57 
 
 		 476 aa  91.3  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  34.41 
 
 		 479 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  32.54 
 
 		 458 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  35.16 
 
 		 510 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  32.54 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  35.88 
 
 		 474 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  35.29 
 
 		 474 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  33.51 
 
 		 504 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  32.7 
 
 		 459 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  33.53 
 
 		 507 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  33.53 
 
 		 505 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  35.19 
 
 		 388 aa  89.7  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  32.88 
 
 		 511 aa  89.4  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  36.71 
 
 		 474 aa  89.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  36.02 
 
 		 502 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  36.02 
 
 		 502 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  36.02 
 
 		 461 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.02 
 
 		 485 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  36.02 
 
 		 502 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2798  ATPase central domain-containing protein  32.62 
 
 		 855 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.416059  normal  0.219212 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  33.53 
 
 		 499 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  33.53 
 
 		 500 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  36.02 
 
 		 485 aa  89  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  34.09 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  36.02 
 
 		 502 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  33.91 
 
 		 484 aa  89  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  36.02 
 
 		 502 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  33.53 
 
 		 499 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  33.53 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  34.32 
 
 		 485 aa  88.6  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  34.71 
 
 		 374 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  33.53 
 
 		 490 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  33.53 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  33.53 
 
 		 498 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0729  periplasmic serine protease DegS  29.22 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.206097  normal  0.0822634 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3655  periplasmic serine protease DegS  29.22 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00040355  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  31.32 
 
 		 513 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  34.73 
 
 		 476 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2386  protease Do  33.33 
 
 		 491 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  30.24 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  32.54 
 
 		 471 aa  87.4  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  33.71 
 
 		 464 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0699  periplasmic serine protease DegS  29.22 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  32.55 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0720  periplasmic serine protease DegS  29.22 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  34.48 
 
 		 359 aa  87  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  28.12 
 
 		 505 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  31.95 
 
 		 464 aa  87  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  32.56 
 
 		 475 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  34.46 
 
 		 506 aa  86.7  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  34.16 
 
 		 476 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  34.04 
 
 		 504 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  34.16 
 
 		 476 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3272  DegS serine peptidase  33.33 
 
 		 360 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.581371  hitchhiker  0.00106456 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  33.51 
 
 		 397 aa  85.9  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  33.51 
 
 		 397 aa  85.9  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  34.46 
 
 		 469 aa  85.9  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  33.94 
 
 		 473 aa  85.9  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0675  DegS serine peptidase  33.33 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  31.7 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3943  protease DegS  33.33 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  31.44 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  34.48 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  35.71 
 
 		 365 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.63 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1392  protease Do  32.14 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0689  DegS serine peptidase  33.33 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0549825  hitchhiker  0.000493421 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  31.7 
 
 		 514 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  25.87 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  34.57 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  32.92 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  35.12 
 
 		 508 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  35.06 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  35.15 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  34.52 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  33.51 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  33.02 
 
 		 528 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  33.52 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  32.37 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.86 
 
 		 366 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>