More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1934 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1934  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 364 aa  752    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2930  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.63 
 
 		 363 aa  328  9e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.12 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.52 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2423  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.27 
 
 		 388 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  38.8 
 
 		 480 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  36.36 
 
 		 476 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3612  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 403 aa  91.3  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220413  normal  0.0189387 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  35.76 
 
 		 516 aa  90.9  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3074  protease DegS  37.64 
 
 		 356 aa  89.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.940129  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.26 
 
 		 473 aa  89.4  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  36.46 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  36.75 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  34.64 
 
 		 500 aa  89  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  35.26 
 
 		 459 aa  87.8  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  35.84 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  36.75 
 
 		 502 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 499 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  36.75 
 
 		 502 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  36.36 
 
 		 490 aa  87.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  36.75 
 
 		 502 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  36.75 
 
 		 502 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  36.75 
 
 		 502 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  36.36 
 
 		 476 aa  86.7  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  36.75 
 
 		 461 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  31.94 
 
 		 375 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  36.75 
 
 		 485 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  32.18 
 
 		 374 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  36.75 
 
 		 485 aa  87  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  34.44 
 
 		 475 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0743  2-alkenal reductase  33 
 
 		 361 aa  86.7  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.107193  normal  0.305104 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  34.34 
 
 		 473 aa  86.3  7e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  35.15 
 
 		 502 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.14 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  32.56 
 
 		 508 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  35.54 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1818  2-alkenal reductase  34.24 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1783  2-alkenal reductase  34.24 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  34.94 
 
 		 500 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  34.94 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  34.94 
 
 		 499 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  34.94 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  34.94 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  34.55 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  34.94 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  34.94 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2702  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.68 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.351014  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  34.94 
 
 		 498 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  33.51 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6421  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  33.33 
 
 		 509 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  35.47 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.78 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  35.76 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  32.6 
 
 		 502 aa  83.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  32.8 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  34.55 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  38.64 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  33.33 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  35.33 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  33.7 
 
 		 505 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  33.33 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  35.54 
 
 		 498 aa  83.2  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  33.33 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  32.77 
 
 		 528 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  34.05 
 
 		 503 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3363  periplasmic serine protease DegS  38.41 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  33.91 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  32.22 
 
 		 466 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  35.47 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  32.95 
 
 		 471 aa  82.8  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  33.66 
 
 		 469 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  31.51 
 
 		 379 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  36.69 
 
 		 485 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  33.73 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  36.69 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.05 
 
 		 375 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  32.39 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  36.02 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  36.02 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  36.02 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  36.02 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  35.76 
 
 		 504 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  36.02 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  35.03 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  36.02 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  34.62 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  34.83 
 
 		 537 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  34.08 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  30.39 
 
 		 502 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  36.02 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  34.41 
 
 		 492 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.31 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  33.84 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  37.87 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  31.15 
 
 		 523 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  33.15 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>