More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1313 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1313  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 264 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1619  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  70.31 
 
 		 242 aa  265  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.527174 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  54.15 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1098  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.32 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.21329  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  28.99 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  28.99 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  28.99 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0471  serine endoprotease  29.41 
 
 		 355 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  28.99 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03095  serine endoprotease, periplasmic  28.99 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  28.99 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  28.99 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03046  hypothetical protein  28.99 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  28.99 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  28.99 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  28.99 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  28.57 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  30.92 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  28.99 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  33.66 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.72 
 
 		 417 aa  75.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  37.13 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2751  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.8 
 
 		 357 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3643  serine endoprotease  31.02 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  34.27 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.22 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  29.2 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  35.58 
 
 		 528 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03179  serine protease DegS  36.91 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00219813  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  30.04 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  33.68 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  33.89 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  29.84 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  29.67 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0669  2-alkenal reductase  32.02 
 
 		 524 aa  72.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3167  DEAD/DEAH box helicase-like  34.01 
 
 		 384 aa  73.2  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  31.55 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  37.67 
 
 		 472 aa  72.4  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  32.29 
 
 		 365 aa  72.4  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.8 
 
 		 457 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  31.95 
 
 		 464 aa  72.4  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  28.47 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  30.56 
 
 		 425 aa  72  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.21 
 
 		 366 aa  72  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  32.95 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  33.87 
 
 		 506 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  34.05 
 
 		 528 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  32.95 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  33.51 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  26.99 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  33.81 
 
 		 451 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  32.14 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  30.77 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  34.36 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.82 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1097  peptidase S1C, Do  33.54 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.676957  normal  0.0936478 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  30.68 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  35.88 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  33.81 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3888  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.06 
 
 		 506 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  30.72 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  32.12 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3344  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.13 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  32.29 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  35.29 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  34.29 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  35.82 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.03 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  32.14 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  32.14 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  32.32 
 
 		 483 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  32.32 
 
 		 483 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  32.39 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  32.39 
 
 		 383 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  30 
 
 		 461 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0073  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.16 
 
 		 474 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 		 380 aa  68.9  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  32.97 
 
 		 523 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  25.18 
 
 		 442 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0267  protease Do  31.28 
 
 		 477 aa  68.6  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.326354  normal  0.464292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3801  serine endoprotease  29.26 
 
 		 354 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000336047  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  30.32 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1990  Colicin V production protein  30.13 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.510104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  30.77 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  31.74 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  30.32 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.53 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  31.33 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  26.42 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  32.35 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.39 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  29.73 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  34.36 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  30.3 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  34.06 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  33.54 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0741  periplasmic serine protease DegS  30.22 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.905633  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.69 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  39.16 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>