12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0424 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0424  AAA ATPase  100 
 
 		 340 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.629135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4622  AAA ATPase  80.35 
 
 		 347 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0368168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1898  AAA ATPase  43.98 
 
 		 354 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3379  AAA ATPase  28.09 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.562242  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5277  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic contain C-terminal PDZ domain-like protein  26.5 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.274664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4452  ATPase  30.39 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.84 
 
 		 921 aa  46.2  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4444  hypothetical protein  24.49 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.3549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1782  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.78638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 953 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1785  hypothetical protein  27.48 
 
 		 425 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00000770102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  29.6 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>