242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2525 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  100 
 
 
334 aa  685    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  58.64 
 
 
341 aa  388  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  58.8 
 
 
368 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  49.15 
 
 
364 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  52.38 
 
 
349 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  51.5 
 
 
353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  50.31 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  56.85 
 
 
371 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  48.84 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  56.6 
 
 
831 aa  319  3.9999999999999996e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  50.74 
 
 
414 aa  285  5.999999999999999e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  51.1 
 
 
357 aa  285  7e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  49.07 
 
 
422 aa  276  4e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  50.69 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  52.4 
 
 
389 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  51.78 
 
 
341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  49.25 
 
 
532 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  38.92 
 
 
385 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  40.42 
 
 
392 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  40.86 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  41.33 
 
 
390 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  40.51 
 
 
393 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.22 
 
 
532 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  41.18 
 
 
540 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  40.96 
 
 
563 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.85 
 
 
372 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.63 
 
 
536 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.59 
 
 
395 aa  212  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.85 
 
 
372 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.14 
 
 
580 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.14 
 
 
577 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.48 
 
 
562 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  35.82 
 
 
387 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.31 
 
 
395 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  38.49 
 
 
439 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  39.7 
 
 
284 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  36.8 
 
 
271 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.6 
 
 
562 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  39.29 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  39.34 
 
 
427 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  40.16 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  42.4 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.57 
 
 
587 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.16 
 
 
558 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.1 
 
 
536 aa  199  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.37 
 
 
564 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.81 
 
 
536 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.48 
 
 
568 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.56 
 
 
541 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  37.54 
 
 
381 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  40.96 
 
 
554 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  41.6 
 
 
563 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
562 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
562 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
562 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.11 
 
 
613 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
559 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
557 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
557 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
557 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  41.04 
 
 
563 aa  192  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.16 
 
 
572 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.48 
 
 
557 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.56 
 
 
538 aa  192  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.33 
 
 
557 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  38.34 
 
 
303 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.25 
 
 
589 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  36.33 
 
 
388 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  38.15 
 
 
584 aa  183  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  41.15 
 
 
354 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  36.7 
 
 
388 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  36.16 
 
 
281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 
562 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  34.93 
 
 
302 aa  175  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  37.75 
 
 
541 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  37.87 
 
 
498 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  35.69 
 
 
300 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  33.96 
 
 
505 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  36.11 
 
 
300 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  36.95 
 
 
538 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  34.81 
 
 
302 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  37.92 
 
 
267 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  37.31 
 
 
570 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  34.11 
 
 
519 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  36.06 
 
 
300 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  37.6 
 
 
274 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  36.8 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  37.21 
 
 
274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  36.8 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  36.8 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  36.8 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  33.96 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.48 
 
 
556 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  37.21 
 
 
274 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  35.74 
 
 
459 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  36.19 
 
 
267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  33.58 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  35.58 
 
 
296 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  35.47 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  36.8 
 
 
529 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>