233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0637 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  100 
 
 		 368 aa  755    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  47.55 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  42.26 
 
 		 437 aa  242  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  39.39 
 
 		 447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  39.87 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  35.96 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  39.08 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  38.01 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  37.15 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 562 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  36.08 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  41.92 
 
 		 275 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  37.2 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  40.48 
 
 		 549 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  37.64 
 
 		 310 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  37.59 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  40.64 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.61 
 
 		 562 aa  196  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  37.59 
 
 		 309 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 568 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  36.04 
 
 		 314 aa  192  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  39.44 
 
 		 388 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  39.36 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  35.74 
 
 		 563 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  39.2 
 
 		 291 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  35.71 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  35.71 
 
 		 302 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  35.9 
 
 		 281 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  35.71 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  35.71 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  38.61 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  37.69 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  34.71 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.4 
 
 		 577 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.4 
 
 		 580 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.45 
 
 		 564 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  39.15 
 
 		 296 aa  186  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  36.86 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  34.01 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  38.8 
 
 		 271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  39.15 
 
 		 279 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  39.44 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  35.69 
 
 		 498 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.82 
 
 		 536 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38 
 
 		 532 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  37.75 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  37.97 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  38 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  38 
 
 		 562 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 589 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.49 
 
 		 536 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.89 
 
 		 536 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  37.75 
 
 		 282 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  34.33 
 
 		 302 aa  176  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  38.25 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  39.08 
 
 		 302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.78 
 
 		 587 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  37.31 
 
 		 529 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.55 
 
 		 558 aa  171  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  35.57 
 
 		 563 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 613 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  34.33 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.35 
 
 		 538 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  37.45 
 
 		 541 aa  169  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  36.9 
 
 		 563 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 562 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 562 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 562 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  34.92 
 
 		 584 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.82 
 
 		 541 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  37.05 
 
 		 538 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  34.12 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.14 
 
 		 557 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 557 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 559 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  35.04 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  35.63 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 557 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  33.47 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 557 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  33.58 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 572 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  35 
 
 		 519 aa  162  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  33.2 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  36.15 
 
 		 392 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.8 
 
 		 556 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  37.41 
 
 		 439 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  32.66 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.33 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  34.78 
 
 		 303 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  35.69 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  34.67 
 
 		 385 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  34.07 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  31.91 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 557 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  31.82 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  36.24 
 
 		 261 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  34.39 
 
 		 831 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  31.75 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.2 
 
 		 353 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>