241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1766 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 
564 aa  1144    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.45 
 
 
536 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  41.65 
 
 
540 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.98 
 
 
562 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  55.6 
 
 
291 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  54.91 
 
 
291 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.97 
 
 
532 aa  286  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
536 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.37 
 
 
536 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.68 
 
 
557 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.68 
 
 
557 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.68 
 
 
557 aa  276  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.39 
 
 
538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.01 
 
 
557 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.94 
 
 
554 aa  270  5e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.6 
 
 
559 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.18 
 
 
562 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.45 
 
 
541 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.16 
 
 
558 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.97 
 
 
577 aa  261  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  49.08 
 
 
563 aa  261  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.93 
 
 
562 aa  261  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.97 
 
 
580 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.25 
 
 
562 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.08 
 
 
562 aa  260  5.0000000000000005e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.22 
 
 
587 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  52.42 
 
 
549 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.12 
 
 
568 aa  257  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.55 
 
 
589 aa  258  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  33.98 
 
 
563 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.98 
 
 
572 aa  254  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 
557 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.05 
 
 
562 aa  253  8.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  47.23 
 
 
271 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  31.49 
 
 
584 aa  247  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  33.63 
 
 
529 aa  247  4.9999999999999997e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.76 
 
 
613 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  45.39 
 
 
385 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  48.31 
 
 
393 aa  237  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.18 
 
 
519 aa  235  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.08 
 
 
556 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  45.32 
 
 
390 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  39.51 
 
 
422 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  47.04 
 
 
392 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  45.15 
 
 
395 aa  230  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  40.79 
 
 
563 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  45.32 
 
 
541 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  40.45 
 
 
303 aa  224  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  44.81 
 
 
538 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  44.48 
 
 
570 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  45.25 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  45.25 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  43.82 
 
 
387 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  45.1 
 
 
439 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.71 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  41.73 
 
 
498 aa  207  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  39.21 
 
 
388 aa  207  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  39.79 
 
 
302 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  38.49 
 
 
388 aa  206  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  37.01 
 
 
505 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  41.64 
 
 
427 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  38.52 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  39.1 
 
 
341 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.58 
 
 
353 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  40.89 
 
 
371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  39.33 
 
 
349 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  39.67 
 
 
300 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  39.85 
 
 
831 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  41.67 
 
 
275 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  39.93 
 
 
300 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  41.37 
 
 
334 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  37.76 
 
 
358 aa  196  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  40 
 
 
308 aa  195  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  41.97 
 
 
296 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  39.59 
 
 
302 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  40.96 
 
 
302 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  40.96 
 
 
302 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  40.07 
 
 
281 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  39.59 
 
 
302 aa  193  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  38.26 
 
 
302 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  40.29 
 
 
310 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  40.44 
 
 
309 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  43.24 
 
 
381 aa  189  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.08 
 
 
364 aa  189  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  42.63 
 
 
310 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  37.58 
 
 
314 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  40.07 
 
 
309 aa  188  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  37.59 
 
 
284 aa  186  8e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  37.08 
 
 
357 aa  186  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  42.75 
 
 
304 aa  186  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  39.45 
 
 
368 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  40.45 
 
 
291 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  40.36 
 
 
302 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  36.3 
 
 
338 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  40.73 
 
 
301 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  38.69 
 
 
302 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  39.39 
 
 
354 aa  183  9.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  39.22 
 
 
459 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  41.96 
 
 
437 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  39.92 
 
 
308 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>