225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0977 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  100 
 
 		 498 aa  1009    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  42.44 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  54.96 
 
 		 388 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  53.55 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  37.88 
 
 		 393 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.57 
 
 		 562 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.25 
 
 		 536 aa  224  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.59 
 
 		 558 aa  224  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 562 aa  223  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  40.36 
 
 		 291 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  40 
 
 		 291 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.38 
 
 		 536 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  41.52 
 
 		 540 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.5 
 
 		 562 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.73 
 
 		 557 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  40.57 
 
 		 385 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.39 
 
 		 568 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.09 
 
 		 577 aa  216  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.09 
 
 		 580 aa  216  9e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.22 
 
 		 557 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.22 
 
 		 557 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.46 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  41.3 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.04 
 
 		 572 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.67 
 
 		 587 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.93 
 
 		 557 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  39.93 
 
 		 392 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  41.04 
 
 		 271 aa  213  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.52 
 
 		 562 aa  213  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  40.37 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.09 
 
 		 562 aa  212  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.26 
 
 		 536 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.1 
 
 		 564 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.65 
 
 		 559 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 562 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  40 
 
 		 563 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.29 
 
 		 613 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  42.18 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.44 
 
 		 541 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  42.05 
 
 		 303 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.3 
 
 		 395 aa  202  8e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.3 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.3 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.78 
 
 		 532 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  39.93 
 
 		 318 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 538 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.81 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  39.77 
 
 		 563 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  41.96 
 
 		 529 aa  193  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  40.67 
 
 		 563 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  36.12 
 
 		 302 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  38.28 
 
 		 300 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 556 aa  187  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  36.47 
 
 		 584 aa  186  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  39.33 
 
 		 387 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  35.82 
 
 		 368 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  38.25 
 
 		 281 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.46 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  36.33 
 
 		 459 aa  179  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.68 
 
 		 346 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  35.71 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  38.46 
 
 		 538 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  39.34 
 
 		 275 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  38.03 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  38.03 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  38.03 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  35.82 
 
 		 279 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  38.17 
 
 		 439 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  38.46 
 
 		 541 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  37.87 
 
 		 334 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  37.68 
 
 		 302 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.45 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  35.86 
 
 		 301 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  35.79 
 
 		 371 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  36.23 
 
 		 414 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  34.87 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  37.7 
 
 		 831 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  37.55 
 
 		 323 aa  171  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  37.78 
 
 		 308 aa  171  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  34.28 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  34.81 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  38.29 
 
 		 300 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  34.33 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  36.75 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  36.43 
 
 		 296 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  43.08 
 
 		 570 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.19 
 
 		 364 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  34.88 
 
 		 302 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  33.11 
 
 		 302 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  34.54 
 
 		 310 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  33.58 
 
 		 532 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  36.12 
 
 		 318 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  34.19 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  33.44 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  35.46 
 
 		 310 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  35.56 
 
 		 291 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  34.01 
 
 		 320 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  34.73 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  35.58 
 
 		 358 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  36.15 
 
 		 302 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>