235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3346 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  100 
 
 		 304 aa  617  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  69.15 
 
 		 314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  69 
 
 		 302 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  67.12 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  68.63 
 
 		 302 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  68.63 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  69.18 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  70.63 
 
 		 309 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  68.63 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  65.12 
 
 		 308 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  70.26 
 
 		 309 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  66.21 
 
 		 302 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  68.27 
 
 		 302 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  66.21 
 
 		 301 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  64.24 
 
 		 302 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  60.81 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  52.56 
 
 		 302 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  58.52 
 
 		 300 aa  323  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  55.79 
 
 		 300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  50 
 
 		 300 aa  285  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  53.33 
 
 		 281 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  55.39 
 
 		 275 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  52.94 
 
 		 279 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  53.16 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  50.37 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  51.67 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  53.14 
 
 		 281 aa  256  5e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  51.67 
 
 		 323 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  45 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  49.43 
 
 		 261 aa  238  8e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  43.97 
 
 		 447 aa  236  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  49.43 
 
 		 261 aa  236  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  44.29 
 
 		 310 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  45.29 
 
 		 437 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.95 
 
 		 538 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.8 
 
 		 536 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.52 
 
 		 541 aa  202  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.53 
 
 		 536 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.84 
 
 		 558 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.79 
 
 		 536 aa  198  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  42.86 
 
 		 563 aa  195  8.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  40.89 
 
 		 540 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  40.49 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  39.15 
 
 		 368 aa  192  4e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.46 
 
 		 587 aa  192  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.69 
 
 		 559 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  43.45 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.47 
 
 		 562 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  40 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.73 
 
 		 562 aa  189  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.7 
 
 		 562 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  41.69 
 
 		 554 aa  189  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.69 
 
 		 562 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.69 
 
 		 562 aa  188  9e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.41 
 
 		 572 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  40.06 
 
 		 519 aa  187  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.69 
 
 		 562 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.75 
 
 		 564 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.47 
 
 		 557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.47 
 
 		 557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.47 
 
 		 557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.88 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  41.86 
 
 		 563 aa  183  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  38.64 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.35 
 
 		 557 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.49 
 
 		 613 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  41.63 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  43.48 
 
 		 549 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  41.74 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  41.25 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.73 
 
 		 568 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  42.35 
 
 		 538 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.83 
 
 		 580 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.83 
 
 		 577 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  38.13 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  38.55 
 
 		 427 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  41.57 
 
 		 541 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  38.69 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  40 
 
 		 584 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.6 
 
 		 532 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  41.43 
 
 		 529 aa  172  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  37.67 
 
 		 563 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  36.19 
 
 		 388 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  37.98 
 
 		 422 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.68 
 
 		 589 aa  167  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  36.5 
 
 		 390 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  35.8 
 
 		 388 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  39.23 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.11 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  36.76 
 
 		 498 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  37.35 
 
 		 334 aa  162  6e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  38.91 
 
 		 392 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  36.33 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  38.25 
 
 		 831 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.39 
 
 		 556 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  36.6 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  36.61 
 
 		 393 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.67 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  45.93 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  32.27 
 
 		 368 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>