238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5029 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  100 
 
 		 346 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  53.91 
 
 		 357 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  55.71 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  46.77 
 
 		 371 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  53.53 
 
 		 338 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  50.18 
 
 		 358 aa  296  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  49.81 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  51.66 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  50.69 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  49.26 
 
 		 414 aa  280  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  47.33 
 
 		 831 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  47.74 
 
 		 353 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  46.18 
 
 		 349 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  46.3 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  46.13 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  44.7 
 
 		 532 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  42.58 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  41.76 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  41.11 
 
 		 385 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  38.29 
 
 		 390 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  39.03 
 
 		 392 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  33.74 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.55 
 
 		 395 aa  209  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  36.08 
 
 		 291 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  38.95 
 
 		 291 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.01 
 
 		 577 aa  203  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.01 
 
 		 580 aa  203  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.53 
 
 		 562 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.56 
 
 		 536 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  40.52 
 
 		 266 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  38.38 
 
 		 563 aa  199  5e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.84 
 
 		 372 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.39 
 
 		 562 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.64 
 
 		 568 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.84 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  35.93 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  33.71 
 
 		 271 aa  196  6e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  42.32 
 
 		 381 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.89 
 
 		 562 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.06 
 
 		 532 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  38.58 
 
 		 266 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  35.66 
 
 		 584 aa  189  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  37.83 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.97 
 
 		 589 aa  189  9e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  38.4 
 
 		 302 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  36.12 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.19 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.55 
 
 		 536 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.17 
 
 		 536 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  38.82 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.08 
 
 		 554 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  34.6 
 
 		 540 aa  185  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  37.17 
 
 		 267 aa  185  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  34.32 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  34.2 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 		 562 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  38.15 
 
 		 439 aa  183  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.08 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  34.08 
 
 		 541 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  38.37 
 
 		 563 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.5 
 
 		 558 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  41.53 
 
 		 304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.46 
 
 		 538 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  36.98 
 
 		 498 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  35.85 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 572 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.45 
 
 		 557 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 564 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 559 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  34.96 
 
 		 427 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  38.55 
 
 		 563 aa  179  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.57 
 
 		 587 aa  179  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  37.59 
 
 		 267 aa  179  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  34.57 
 
 		 549 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  38.43 
 
 		 570 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  38.11 
 
 		 529 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  39.84 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 613 aa  175  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 541 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  36.53 
 
 		 519 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  35.79 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  33.82 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.2 
 
 		 538 aa  170  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.75 
 
 		 556 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  37.93 
 
 		 302 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  35.61 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  36.69 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  36.84 
 
 		 302 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  36.29 
 
 		 281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  35.8 
 
 		 291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  37.93 
 
 		 310 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  37.5 
 
 		 314 aa  167  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  37.1 
 
 		 279 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  36.47 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  36.47 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>