245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0754 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  100 
 
 
279 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  52.86 
 
 
302 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  57.41 
 
 
281 aa  308  9e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  54.85 
 
 
300 aa  288  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  54.81 
 
 
300 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  50.72 
 
 
296 aa  285  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  52.94 
 
 
304 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  53.73 
 
 
314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  52.16 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  52.5 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  52.5 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  52.5 
 
 
302 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  53.16 
 
 
309 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  51.61 
 
 
302 aa  281  8.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  52.14 
 
 
302 aa  281  9e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  53.16 
 
 
310 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  52.79 
 
 
309 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  52.31 
 
 
291 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  52.33 
 
 
302 aa  279  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  55.31 
 
 
275 aa  276  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  51.8 
 
 
301 aa  275  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  54.12 
 
 
300 aa  276  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  51.62 
 
 
308 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  50.56 
 
 
302 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  47.6 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  46.9 
 
 
310 aa  249  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  50.74 
 
 
323 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  48.88 
 
 
281 aa  240  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  45.66 
 
 
459 aa  231  7.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  43.01 
 
 
447 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  43.91 
 
 
282 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  45.69 
 
 
437 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  44 
 
 
261 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  44.8 
 
 
261 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.19 
 
 
536 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.82 
 
 
536 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  41.07 
 
 
291 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.99 
 
 
562 aa  205  6e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.18 
 
 
536 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  41.73 
 
 
271 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  41.07 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  40.73 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  41.09 
 
 
540 aa  195  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.11 
 
 
562 aa  195  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.56 
 
 
558 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.97 
 
 
562 aa  192  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 
587 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  39.15 
 
 
368 aa  192  5e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  42.64 
 
 
549 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.29 
 
 
538 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  41.77 
 
 
554 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.86 
 
 
559 aa  188  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
580 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  38.78 
 
 
563 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.08 
 
 
541 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 
562 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 
562 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 
562 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  40 
 
 
519 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.82 
 
 
564 aa  187  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.37 
 
 
572 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.85 
 
 
577 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  38.87 
 
 
563 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.3 
 
 
557 aa  185  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
557 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
557 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.96 
 
 
557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.96 
 
 
557 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  41.77 
 
 
392 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.29 
 
 
532 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.54 
 
 
589 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  36.17 
 
 
498 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.46 
 
 
613 aa  181  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  37.31 
 
 
422 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  36.95 
 
 
390 aa  178  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  35.43 
 
 
385 aa  178  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.15 
 
 
568 aa  178  9e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  39.2 
 
 
393 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  40.82 
 
 
303 aa  177  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.2 
 
 
372 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.2 
 
 
372 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  36.08 
 
 
388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.02 
 
 
346 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  36.96 
 
 
541 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  36.08 
 
 
388 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  38.38 
 
 
529 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  36.96 
 
 
538 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  43.58 
 
 
570 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  37.82 
 
 
563 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  38.67 
 
 
308 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  36.33 
 
 
831 aa  169  7e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  35.4 
 
 
318 aa  168  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  36.4 
 
 
267 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  37.25 
 
 
357 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  37.12 
 
 
302 aa  167  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  35.94 
 
 
427 aa  166  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.49 
 
 
395 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  37.35 
 
 
334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  37.25 
 
 
439 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  36.8 
 
 
267 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>