222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2821 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  100 
 
 		 281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  58.72 
 
 		 282 aa  342  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  62.07 
 
 		 261 aa  340  1e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  61.15 
 
 		 261 aa  332  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  52.13 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  52.13 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  52.13 
 
 		 302 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  52.13 
 
 		 302 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  51.76 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  52.75 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  52.5 
 
 		 302 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  51.61 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  51.62 
 
 		 309 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  53.7 
 
 		 314 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  51.26 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  51.09 
 
 		 302 aa  261  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  52.14 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  51.13 
 
 		 300 aa  257  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  53.14 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  50.93 
 
 		 302 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  49.82 
 
 		 300 aa  248  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  47.25 
 
 		 300 aa  246  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  51.84 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  47.08 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  48.31 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  48.88 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  45.35 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  44.33 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  43.51 
 
 		 459 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  44.81 
 
 		 323 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  41.95 
 
 		 447 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  41.55 
 
 		 437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  39.64 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  44.36 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  42.59 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  46.37 
 
 		 549 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  38.54 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  39.69 
 
 		 563 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  37.75 
 
 		 368 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  39.44 
 
 		 584 aa  177  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 536 aa  176  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.16 
 
 		 536 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.37 
 
 		 536 aa  175  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  41.07 
 
 		 540 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  39.85 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  39.06 
 
 		 538 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.02 
 
 		 558 aa  170  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  42.02 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  36.9 
 
 		 541 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.8 
 
 		 613 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  39.93 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.93 
 
 		 589 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.85 
 
 		 562 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  38.98 
 
 		 519 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  39.37 
 
 		 529 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.47 
 
 		 572 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.63 
 
 		 562 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.85 
 
 		 538 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.94 
 
 		 562 aa  163  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.28 
 
 		 554 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  36.4 
 
 		 302 aa  162  7e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.23 
 
 		 541 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  37.94 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.92 
 
 		 532 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  36.68 
 
 		 563 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 557 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 562 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 562 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 557 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.53 
 
 		 557 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 557 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.92 
 
 		 562 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.65 
 
 		 587 aa  159  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  36.43 
 
 		 498 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.64 
 
 		 568 aa  159  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.54 
 
 		 556 aa  157  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.63 
 
 		 559 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  45.58 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  37.86 
 
 		 563 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.43 
 
 		 557 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  39.44 
 
 		 393 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  33.71 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.42 
 
 		 577 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  36.44 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  37.71 
 
 		 346 aa  151  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  36.36 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  33.71 
 
 		 390 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 580 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.45 
 
 		 564 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  37.2 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  36.22 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  33.58 
 
 		 542 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.25 
 
 		 395 aa  148  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  34.88 
 
 		 422 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  33.07 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  32.68 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  36.29 
 
 		 358 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.61 
 
 		 372 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  32.28 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.61 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>