245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2879 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  100 
 
 
422 aa  875    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  45.39 
 
 
388 aa  358  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  42.77 
 
 
498 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  53.43 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  43.12 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.08 
 
 
536 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  42.38 
 
 
291 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.95 
 
 
564 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.12 
 
 
536 aa  229  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.12 
 
 
536 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.36 
 
 
562 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.35 
 
 
532 aa  224  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.65 
 
 
577 aa  223  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.22 
 
 
580 aa  223  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  40.15 
 
 
540 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 
562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.22 
 
 
568 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  40.45 
 
 
271 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  38.29 
 
 
563 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  40.66 
 
 
387 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  41.39 
 
 
563 aa  210  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.12 
 
 
562 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  39.19 
 
 
385 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  39.19 
 
 
393 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.1 
 
 
372 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.29 
 
 
558 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.64 
 
 
613 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.73 
 
 
372 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.83 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.83 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  42.22 
 
 
549 aa  200  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.16 
 
 
587 aa  200  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  37.73 
 
 
392 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  40.75 
 
 
563 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  41.03 
 
 
303 aa  196  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  37 
 
 
390 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.94 
 
 
572 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.8 
 
 
538 aa  193  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.98 
 
 
364 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.59 
 
 
556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 
589 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  38.11 
 
 
296 aa  189  7e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.71 
 
 
557 aa  189  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  34.26 
 
 
541 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  35.23 
 
 
584 aa  188  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  38.82 
 
 
439 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.68 
 
 
562 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  36.76 
 
 
554 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.16 
 
 
562 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.66 
 
 
541 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.1 
 
 
557 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.1 
 
 
557 aa  186  9e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  36.86 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.1 
 
 
557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.95 
 
 
557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.22 
 
 
562 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.22 
 
 
559 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  33.63 
 
 
538 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  36.71 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  36.58 
 
 
301 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  36.79 
 
 
529 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  38.32 
 
 
281 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  35.66 
 
 
358 aa  178  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  37.5 
 
 
302 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.21 
 
 
353 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  32.65 
 
 
320 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  34.4 
 
 
318 aa  177  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  35.47 
 
 
427 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  33.14 
 
 
459 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  38.11 
 
 
519 aa  176  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  33 
 
 
437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  37.31 
 
 
279 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  35.53 
 
 
740 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  34.59 
 
 
371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  37.32 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  34.34 
 
 
368 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  37.88 
 
 
310 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  35.59 
 
 
300 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  33.83 
 
 
831 aa  170  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  37.98 
 
 
304 aa  169  8e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  32.84 
 
 
414 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  37.21 
 
 
314 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  35.5 
 
 
308 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  36.3 
 
 
291 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  33.82 
 
 
346 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  37.9 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  32.78 
 
 
302 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  34.96 
 
 
300 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  34.55 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  32.53 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  32.78 
 
 
302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  35.29 
 
 
309 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  35.29 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  35.69 
 
 
310 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  31.32 
 
 
341 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  33.68 
 
 
302 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  34.9 
 
 
309 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  33.08 
 
 
281 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  34.96 
 
 
267 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  35.29 
 
 
381 aa  160  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>