239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0662 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  100 
 
 		 368 aa  755    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  63.51 
 
 		 358 aa  451  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  60.7 
 
 		 341 aa  358  6e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  50.82 
 
 		 364 aa  357  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  58.8 
 
 		 334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  56.88 
 
 		 831 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  47.96 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  57.25 
 
 		 353 aa  312  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  55.09 
 
 		 371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  51.28 
 
 		 414 aa  295  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  50.18 
 
 		 338 aa  295  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  46.43 
 
 		 357 aa  291  9e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  47.4 
 
 		 422 aa  283  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  50.17 
 
 		 532 aa  282  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  49.81 
 
 		 346 aa  276  4e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  49.28 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  49.43 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  43.85 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  37.46 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  39.63 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  40.45 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  41.64 
 
 		 372 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.32 
 
 		 536 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  38.46 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.97 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.79 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  39.2 
 
 		 308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.33 
 
 		 395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  37.31 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  42.48 
 
 		 284 aa  212  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  38.58 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.38 
 
 		 562 aa  205  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  40 
 
 		 427 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.03 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.6 
 
 		 532 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.76 
 
 		 577 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.52 
 
 		 564 aa  202  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  40.08 
 
 		 291 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  40.08 
 
 		 291 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  36.59 
 
 		 540 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  38.43 
 
 		 563 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.52 
 
 		 568 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  39.48 
 
 		 381 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.32 
 
 		 536 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.32 
 
 		 536 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.42 
 
 		 557 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.08 
 
 		 558 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  39.02 
 
 		 563 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.9 
 
 		 562 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  38.43 
 
 		 584 aa  190  4e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.58 
 
 		 613 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  36.36 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  37.23 
 
 		 281 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.54 
 
 		 562 aa  186  4e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  38.58 
 
 		 549 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.11 
 
 		 554 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.98 
 
 		 572 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.29 
 
 		 541 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.83 
 
 		 587 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.73 
 
 		 562 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.73 
 
 		 562 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.14 
 
 		 589 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  39.11 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.69 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.32 
 
 		 557 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.92 
 
 		 559 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.49 
 
 		 538 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  35.93 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  35.71 
 
 		 498 aa  178  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  39.2 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.52 
 
 		 556 aa  176  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  36.9 
 
 		 563 aa  175  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  36.4 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  34.34 
 
 		 422 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  35.9 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  34.08 
 
 		 541 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  36.19 
 
 		 570 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  36.03 
 
 		 267 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  35.63 
 
 		 302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  35.16 
 
 		 266 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  33.47 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  34.7 
 
 		 266 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  34.7 
 
 		 266 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.68 
 
 		 538 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  34.57 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  34.69 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  34.69 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  34.69 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  32.13 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  34.32 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  34.68 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  34.38 
 
 		 291 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  38.67 
 
 		 274 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  34.43 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  34.12 
 
 		 300 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  32.81 
 
 		 447 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  32.27 
 
 		 304 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>