236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2822 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 556 aa  1112    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  59.04 
 
 		 563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.04 
 
 		 589 aa  580  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  77.62 
 
 		 568 aa  426  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  74.54 
 
 		 562 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  73.31 
 
 		 577 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  73.74 
 
 		 580 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  43.32 
 
 		 549 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.77 
 
 		 562 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.14 
 
 		 562 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  36.1 
 
 		 584 aa  350  4e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.96 
 
 		 562 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  37.88 
 
 		 563 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.03 
 
 		 538 aa  340  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.57 
 
 		 562 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.15 
 
 		 558 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 572 aa  336  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.92 
 
 		 557 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  38 
 
 		 587 aa  333  5e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.92 
 
 		 559 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.83 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.98 
 
 		 557 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.83 
 
 		 557 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  38.42 
 
 		 554 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.75 
 
 		 557 aa  329  8e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  36.11 
 
 		 541 aa  322  8e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.29 
 
 		 613 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  41.07 
 
 		 570 aa  316  9e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.17 
 
 		 538 aa  297  3e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  54.1 
 
 		 563 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  34.75 
 
 		 529 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  49.01 
 
 		 303 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  33.27 
 
 		 519 aa  266  5e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.51 
 
 		 564 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 536 aa  260  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  34.36 
 
 		 540 aa  257  4e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  49.08 
 
 		 291 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  49.08 
 
 		 291 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.73 
 
 		 562 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.94 
 
 		 536 aa  236  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  39.04 
 
 		 385 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  43.59 
 
 		 392 aa  233  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  42.14 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  38.7 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  44.94 
 
 		 271 aa  227  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  46.83 
 
 		 372 aa  226  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  46.43 
 
 		 372 aa  226  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  43.63 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  45.63 
 
 		 393 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.85 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.49 
 
 		 395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  41.55 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  41.31 
 
 		 439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  40.97 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.86 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  41.67 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  41.67 
 
 		 388 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  40.43 
 
 		 357 aa  207  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.09 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  45.74 
 
 		 257 aa  205  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  38.52 
 
 		 368 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  38.64 
 
 		 341 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.75 
 
 		 346 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  44.81 
 
 		 381 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  40.37 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  42.28 
 
 		 831 aa  196  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  40.32 
 
 		 302 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  40.32 
 
 		 302 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  40.32 
 
 		 302 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  42.11 
 
 		 308 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  40 
 
 		 302 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  42.76 
 
 		 300 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  41.5 
 
 		 371 aa  194  4e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  40.31 
 
 		 302 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  40.86 
 
 		 284 aa  193  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  38.8 
 
 		 300 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  37.37 
 
 		 358 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  38.69 
 
 		 338 aa  189  9e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.16 
 
 		 334 aa  189  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  40.68 
 
 		 308 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  38.57 
 
 		 275 aa  187  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  39.61 
 
 		 310 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  42.49 
 
 		 301 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  40.28 
 
 		 309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  39.71 
 
 		 266 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  40.58 
 
 		 310 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  40 
 
 		 267 aa  183  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  39.93 
 
 		 309 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  36.21 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  41.2 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  37.09 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  38.24 
 
 		 302 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  38.25 
 
 		 389 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  34.38 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  34.63 
 
 		 368 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  38.69 
 
 		 302 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  39.19 
 
 		 266 aa  180  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  38.15 
 
 		 267 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  41.39 
 
 		 304 aa  179  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>