236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03091 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  76.95 
 
 		 303 aa  391  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  62.45 
 
 		 563 aa  288  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  63.39 
 
 		 558 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.78 
 
 		 538 aa  261  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.92 
 
 		 613 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.89 
 
 		 541 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.13 
 
 		 587 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.03 
 
 		 557 aa  255  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  62.33 
 
 		 572 aa  250  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 557 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 557 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  55.16 
 
 		 557 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 557 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  55.56 
 
 		 554 aa  248  6e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 562 aa  246  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.16 
 
 		 562 aa  246  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.37 
 
 		 559 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.76 
 
 		 562 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  47.47 
 
 		 538 aa  238  6.999999999999999e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  47.08 
 
 		 541 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  48.45 
 
 		 519 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  54.02 
 
 		 549 aa  231  6e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  56.65 
 
 		 584 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  53.51 
 
 		 563 aa  228  6e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  55.72 
 
 		 529 aa  219  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.11 
 
 		 577 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  48.89 
 
 		 563 aa  207  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.43 
 
 		 580 aa  206  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.69 
 
 		 568 aa  204  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 562 aa  204  8e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  48 
 
 		 556 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 589 aa  198  9e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.33 
 
 		 562 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  46.36 
 
 		 505 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.56 
 
 		 562 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.61 
 
 		 536 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.03 
 
 		 536 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  44.89 
 
 		 291 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  45.78 
 
 		 291 aa  185  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.54 
 
 		 536 aa  185  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  52.7 
 
 		 570 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.09 
 
 		 532 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.1 
 
 		 564 aa  178  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  45.33 
 
 		 540 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  45.6 
 
 		 310 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  43.97 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  44.4 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  43.97 
 
 		 302 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  43.97 
 
 		 302 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  45.67 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  49.01 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  47.85 
 
 		 310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  48.76 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  48.76 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  37.65 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  44.83 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  41.73 
 
 		 302 aa  159  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  42.51 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  41.7 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.03 
 
 		 395 aa  157  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  47.52 
 
 		 301 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  46.79 
 
 		 314 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  45.93 
 
 		 304 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  44.34 
 
 		 302 aa  155  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  45.58 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  47.78 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  40.71 
 
 		 296 aa  153  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  40.23 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.82 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.82 
 
 		 372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  39.02 
 
 		 422 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  45.27 
 
 		 291 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  43.35 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  41.75 
 
 		 392 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.76 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  39.83 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  34.65 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.34 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  42.38 
 
 		 281 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  33.75 
 
 		 385 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  38.69 
 
 		 390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  40.42 
 
 		 300 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  41.67 
 
 		 498 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  40.1 
 
 		 393 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  39.07 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  39.11 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  39.07 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  41.5 
 
 		 308 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.81 
 
 		 364 aa  141  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  36.7 
 
 		 266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  37.33 
 
 		 439 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  37.84 
 
 		 427 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  38.86 
 
 		 341 aa  138  7e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  35.8 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  38.58 
 
 		 387 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  37.95 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  36.32 
 
 		 542 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  32.76 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  38.16 
 
 		 274 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>