234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2582 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  100 
 
 		 381 aa  773    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  47.13 
 
 		 385 aa  246  6e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  47.33 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.78 
 
 		 562 aa  243  6e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.67 
 
 		 577 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.92 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.67 
 
 		 580 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  45.59 
 
 		 372 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  46.62 
 
 		 395 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  45.21 
 
 		 281 aa  236  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  36.29 
 
 		 387 aa  235  8e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  45.21 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  47.04 
 
 		 563 aa  233  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 		 568 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  46.47 
 
 		 549 aa  229  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.68 
 
 		 558 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  41.76 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  36.41 
 
 		 538 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.09 
 
 		 395 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  44.32 
 
 		 563 aa  222  7e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.02 
 
 		 562 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  45.53 
 
 		 529 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  38.56 
 
 		 357 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.66 
 
 		 557 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.04 
 
 		 589 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.76 
 
 		 536 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  41.38 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  44.9 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.66 
 
 		 557 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.66 
 
 		 557 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.66 
 
 		 557 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.66 
 
 		 557 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.56 
 
 		 562 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  44.94 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.15 
 
 		 562 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  44.15 
 
 		 554 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.15 
 
 		 562 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  38.89 
 
 		 371 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.27 
 
 		 353 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  41.55 
 
 		 439 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  37.54 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  39.48 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.51 
 
 		 572 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.18 
 
 		 541 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.32 
 
 		 613 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.79 
 
 		 562 aa  212  7e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.46 
 
 		 559 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  43.56 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.61 
 
 		 587 aa  211  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  41.2 
 
 		 584 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  44.44 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.77 
 
 		 538 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  42.01 
 
 		 271 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  40.98 
 
 		 358 aa  209  7e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  44.35 
 
 		 540 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.24 
 
 		 564 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  38.56 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  42.75 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  39.79 
 
 		 563 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  42.32 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  38.89 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  42.32 
 
 		 831 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  38.76 
 
 		 341 aa  202  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  41.29 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  36.15 
 
 		 349 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.55 
 
 		 364 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.64 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  40.56 
 
 		 532 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  42.64 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.54 
 
 		 536 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.48 
 
 		 536 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  41.31 
 
 		 427 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  37.97 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  40.38 
 
 		 266 aa  192  9e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  43.39 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  40 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  38.58 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  46.75 
 
 		 570 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  38.66 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  41.73 
 
 		 308 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  35.71 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.81 
 
 		 556 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  39.08 
 
 		 267 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  37.93 
 
 		 266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  35.29 
 
 		 422 aa  179  7e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  34.77 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  39.13 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  36.98 
 
 		 498 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  37.12 
 
 		 302 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  35.69 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  35.9 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  37.75 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  38.15 
 
 		 437 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  38.93 
 
 		 314 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  36.78 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  40.38 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  38.98 
 
 		 274 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  38.98 
 
 		 274 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  37.5 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  38.82 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>