249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0835 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  62.25 
 
 		 587 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  61.46 
 
 		 554 aa  690    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  62.68 
 
 		 558 aa  743    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.91 
 
 		 541 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  63.16 
 
 		 572 aa  709    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  60 
 
 		 557 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.62 
 
 		 557 aa  686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.85 
 
 		 559 aa  696    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  61 
 
 		 562 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  62.36 
 
 		 562 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  60 
 
 		 557 aa  681    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.48 
 
 		 557 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  61.65 
 
 		 562 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.16 
 
 		 557 aa  682    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 613 aa  1249    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  72.97 
 
 		 538 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  37.93 
 
 		 584 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  65.93 
 
 		 563 aa  360  3e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  61.2 
 
 		 303 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.13 
 
 		 562 aa  352  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  57.48 
 
 		 549 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  53.72 
 
 		 505 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  46.33 
 
 		 541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  55.26 
 
 		 538 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.02 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  38.1 
 
 		 570 aa  297  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  56.04 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.04 
 
 		 580 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.31 
 
 		 568 aa  294  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  52.15 
 
 		 519 aa  294  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  55.02 
 
 		 563 aa  293  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  50.5 
 
 		 563 aa  293  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.84 
 
 		 562 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  60.92 
 
 		 257 aa  273  5.000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  50.19 
 
 		 529 aa  272  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  50.37 
 
 		 291 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  51.28 
 
 		 291 aa  260  6e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.72 
 
 		 556 aa  260  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.62 
 
 		 536 aa  260  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  45.82 
 
 		 540 aa  258  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  49.45 
 
 		 271 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.07 
 
 		 532 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.2 
 
 		 562 aa  252  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.81 
 
 		 536 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.66 
 
 		 536 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.99 
 
 		 564 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  38.72 
 
 		 390 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  43.24 
 
 		 302 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  41.91 
 
 		 308 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  43.24 
 
 		 302 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  43.24 
 
 		 302 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  43.24 
 
 		 302 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  41.18 
 
 		 498 aa  213  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.79 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  33.64 
 
 		 422 aa  213  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.79 
 
 		 372 aa  212  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  42.75 
 
 		 387 aa  212  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  40.07 
 
 		 385 aa  211  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.21 
 
 		 395 aa  209  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  41.54 
 
 		 393 aa  209  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  41.78 
 
 		 310 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  42.96 
 
 		 300 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  43.89 
 
 		 302 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  40.68 
 
 		 392 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  44.53 
 
 		 302 aa  204  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  42.35 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  44.32 
 
 		 381 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  44.91 
 
 		 300 aa  200  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  44.27 
 
 		 310 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  39.42 
 
 		 388 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  44.27 
 
 		 309 aa  200  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  39.42 
 
 		 388 aa  199  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  42.29 
 
 		 281 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  41.11 
 
 		 334 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  45.28 
 
 		 302 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  43.89 
 
 		 309 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  41.64 
 
 		 266 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.78 
 
 		 395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  40.82 
 
 		 831 aa  197  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  42.42 
 
 		 267 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  43.61 
 
 		 296 aa  196  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  41.26 
 
 		 266 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  42.42 
 
 		 267 aa  195  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  40.47 
 
 		 314 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  45.71 
 
 		 300 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  44.78 
 
 		 291 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.66 
 
 		 364 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  41.24 
 
 		 302 aa  193  7e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  42.09 
 
 		 301 aa  193  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  43.02 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  38.58 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  38.81 
 
 		 266 aa  190  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  44.49 
 
 		 304 aa  190  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  39.84 
 
 		 371 aa  190  7e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  37.59 
 
 		 281 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  37.97 
 
 		 357 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  42.16 
 
 		 275 aa  188  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  36.78 
 
 		 284 aa  187  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  37.97 
 
 		 427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  35.89 
 
 		 447 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>