247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3749 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3749  ATPase  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  51.31 
 
 
540 aa  272  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.78 
 
 
562 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.36 
 
 
536 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  54.18 
 
 
291 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  54.58 
 
 
291 aa  261  6e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.94 
 
 
536 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.74 
 
 
536 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.23 
 
 
564 aa  251  6e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.79 
 
 
562 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.7 
 
 
562 aa  249  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.21 
 
 
532 aa  247  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.45 
 
 
613 aa  247  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  50.19 
 
 
549 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.94 
 
 
558 aa  244  8e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.86 
 
 
580 aa  240  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.86 
 
 
577 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.41 
 
 
562 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.41 
 
 
562 aa  237  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.41 
 
 
562 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.04 
 
 
587 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  45.76 
 
 
563 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  47.04 
 
 
554 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.91 
 
 
541 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.05 
 
 
538 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.39 
 
 
568 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.99 
 
 
557 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.99 
 
 
557 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.99 
 
 
557 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  43.49 
 
 
392 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.99 
 
 
557 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  45.2 
 
 
385 aa  229  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.99 
 
 
572 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.3 
 
 
559 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  44.62 
 
 
303 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.86 
 
 
557 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  42.22 
 
 
584 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.74 
 
 
372 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.74 
 
 
372 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  45.14 
 
 
563 aa  222  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  43.98 
 
 
388 aa  221  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  43.98 
 
 
388 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.42 
 
 
589 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  45.11 
 
 
393 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  43.09 
 
 
390 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  48.13 
 
 
570 aa  218  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  46.96 
 
 
395 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  44.78 
 
 
302 aa  215  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  44.78 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  44.78 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  44.78 
 
 
302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  42.96 
 
 
300 aa  215  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  40.61 
 
 
831 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  44.36 
 
 
519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  41.04 
 
 
498 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  45.35 
 
 
563 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  40.45 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  37.31 
 
 
368 aa  211  9e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  43.14 
 
 
387 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  40.23 
 
 
302 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.84 
 
 
353 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.61 
 
 
395 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  41.18 
 
 
318 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  40.61 
 
 
308 aa  205  6e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  41.18 
 
 
296 aa  204  9e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  37.08 
 
 
371 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  39.85 
 
 
302 aa  203  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  36.84 
 
 
341 aa  202  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  36.8 
 
 
334 aa  203  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  40.23 
 
 
302 aa  203  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  39.85 
 
 
427 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.22 
 
 
364 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  41.82 
 
 
308 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  40.29 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  40.29 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.94 
 
 
556 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  40.75 
 
 
459 aa  198  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  40.23 
 
 
302 aa  198  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  40.98 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  39.93 
 
 
309 aa  198  9e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  42.07 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  40.82 
 
 
310 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  42.49 
 
 
300 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  40.74 
 
 
541 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  40.82 
 
 
538 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  42.28 
 
 
281 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  38 
 
 
349 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  42.91 
 
 
439 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  36.33 
 
 
414 aa  193  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  38.97 
 
 
301 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  42.01 
 
 
381 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  39.63 
 
 
505 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  39.85 
 
 
447 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  34.96 
 
 
358 aa  191  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  41.73 
 
 
275 aa  191  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  36.08 
 
 
338 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  39.63 
 
 
267 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  40.22 
 
 
529 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  41.57 
 
 
291 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  38.35 
 
 
284 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>