244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  100 
 
 
570 aa  1125    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.75 
 
 
558 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.53 
 
 
572 aa  354  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.48 
 
 
587 aa  352  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.96 
 
 
562 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.92 
 
 
538 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.86 
 
 
562 aa  346  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.86 
 
 
559 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  42.04 
 
 
549 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.07 
 
 
557 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.25 
 
 
557 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.25 
 
 
557 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.72 
 
 
557 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.61 
 
 
562 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  40.67 
 
 
554 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  37.08 
 
 
584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.98 
 
 
613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.5 
 
 
557 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.04 
 
 
562 aa  334  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  38.77 
 
 
563 aa  331  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.04 
 
 
541 aa  326  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  55.52 
 
 
563 aa  319  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.35 
 
 
589 aa  306  5.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.74 
 
 
568 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  57.6 
 
 
580 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  57.86 
 
 
577 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  56.34 
 
 
563 aa  288  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  35.17 
 
 
529 aa  281  2e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  49.34 
 
 
303 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  33.68 
 
 
541 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.54 
 
 
538 aa  278  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.32 
 
 
556 aa  274  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  32.7 
 
 
519 aa  271  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 
564 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.25 
 
 
562 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.1 
 
 
536 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.28 
 
 
536 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  47.62 
 
 
271 aa  248  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.79 
 
 
536 aa  247  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  47.72 
 
 
291 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  46.55 
 
 
505 aa  239  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  48.16 
 
 
291 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  52.7 
 
 
257 aa  227  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  46.96 
 
 
532 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  41.86 
 
 
390 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  41.7 
 
 
385 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  46.96 
 
 
395 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  45.6 
 
 
393 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  43.54 
 
 
392 aa  211  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  43.36 
 
 
302 aa  210  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.17 
 
 
372 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.8 
 
 
372 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  41.22 
 
 
284 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  43.08 
 
 
498 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  40.48 
 
 
300 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  46.07 
 
 
300 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  42.69 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  45.88 
 
 
281 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.43 
 
 
346 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  41.3 
 
 
310 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  41.64 
 
 
309 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  40.21 
 
 
300 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  44.71 
 
 
314 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  40.07 
 
 
427 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  41.28 
 
 
309 aa  196  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  40.07 
 
 
308 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  42.37 
 
 
267 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  42.21 
 
 
310 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  40.79 
 
 
437 aa  195  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  42.91 
 
 
308 aa  195  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  46.75 
 
 
381 aa  195  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  37.83 
 
 
388 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  41.57 
 
 
302 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  41.57 
 
 
302 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  41.57 
 
 
302 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  41.57 
 
 
302 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  42.37 
 
 
267 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  40.61 
 
 
302 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  43.25 
 
 
371 aa  191  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  42.8 
 
 
439 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.19 
 
 
364 aa  191  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  44.85 
 
 
275 aa  190  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  40.46 
 
 
302 aa  190  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  41.26 
 
 
395 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  36.7 
 
 
388 aa  189  8e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  40.08 
 
 
354 aa  189  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  41.79 
 
 
831 aa  188  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  43.58 
 
 
279 aa  188  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  38.58 
 
 
266 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  36.9 
 
 
459 aa  187  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  38.4 
 
 
341 aa  187  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  41.24 
 
 
301 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  37.31 
 
 
334 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  36.19 
 
 
368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  34.9 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  41.41 
 
 
296 aa  183  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  39.13 
 
 
302 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  35.8 
 
 
542 aa  183  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  38.8 
 
 
281 aa  182  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  38.43 
 
 
266 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>