246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0061 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  100 
 
 		 549 aa  1104    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.57 
 
 		 558 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  43.87 
 
 		 554 aa  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.25 
 
 		 562 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.34 
 
 		 538 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.2 
 
 		 589 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.34 
 
 		 562 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.36 
 
 		 541 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  42.96 
 
 		 563 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.04 
 
 		 557 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.81 
 
 		 562 aa  382  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.73 
 
 		 557 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 572 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.54 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.54 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.36 
 
 		 557 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.45 
 
 		 587 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  40.63 
 
 		 563 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.2 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.5 
 
 		 562 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.68 
 
 		 562 aa  362  9e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  40.11 
 
 		 541 aa  359  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  38.18 
 
 		 584 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  40 
 
 		 538 aa  347  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  58.58 
 
 		 563 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  38.03 
 
 		 519 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  58.36 
 
 		 577 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  59.19 
 
 		 580 aa  312  9e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.73 
 
 		 613 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  42.4 
 
 		 570 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.09 
 
 		 568 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  37.83 
 
 		 529 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  59.02 
 
 		 303 aa  294  3e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.36 
 
 		 536 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  56.99 
 
 		 556 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  37.07 
 
 		 540 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.13 
 
 		 536 aa  264  4e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.98 
 
 		 564 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 562 aa  259  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  45.79 
 
 		 505 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.14 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.63 
 
 		 532 aa  249  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  50.19 
 
 		 271 aa  247  4e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  48.95 
 
 		 291 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  50.6 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  48.6 
 
 		 291 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  54.02 
 
 		 257 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  45.82 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  46.25 
 
 		 385 aa  224  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  48 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  47.01 
 
 		 372 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  47.01 
 
 		 372 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  45.85 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  45.42 
 
 		 395 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  48.21 
 
 		 395 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  47.92 
 
 		 300 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  40.18 
 
 		 459 aa  213  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  45.06 
 
 		 439 aa  210  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  46.47 
 
 		 381 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.78 
 
 		 353 aa  207  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  42.91 
 
 		 341 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  43.45 
 
 		 300 aa  202  9e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  41.87 
 
 		 498 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  46 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  41.04 
 
 		 388 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  39.93 
 
 		 388 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.15 
 
 		 334 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  42.22 
 
 		 422 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  39.71 
 
 		 338 aa  200  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  44.57 
 
 		 302 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  44.57 
 
 		 302 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  44.57 
 
 		 302 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  41.26 
 
 		 831 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.4 
 
 		 364 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  40.48 
 
 		 368 aa  197  5.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  44.19 
 
 		 302 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  41.67 
 
 		 302 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  40.79 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  41.79 
 
 		 427 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  42.45 
 
 		 310 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  41.64 
 
 		 300 aa  193  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  43.56 
 
 		 281 aa  193  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  43.3 
 
 		 267 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  39.29 
 
 		 282 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  38.24 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  41.55 
 
 		 291 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  41.6 
 
 		 349 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  41.47 
 
 		 302 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  40.92 
 
 		 308 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  42.7 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  43.18 
 
 		 310 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  40.41 
 
 		 284 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  41.43 
 
 		 371 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  42.32 
 
 		 309 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  44.66 
 
 		 301 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  38.95 
 
 		 307 aa  187  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  43.87 
 
 		 314 aa  187  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  38.58 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  40.23 
 
 		 267 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  43.87 
 
 		 296 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>