240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001613 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  82.5 
 
 		 541 aa  926    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  100 
 
 		 538 aa  1106    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  50.57 
 
 		 529 aa  521  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  41.2 
 
 		 519 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  39.43 
 
 		 554 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.51 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.87 
 
 		 562 aa  362  8e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.05 
 
 		 562 aa  359  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.72 
 
 		 558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.48 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.68 
 
 		 557 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.04 
 
 		 557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 557 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.04 
 
 		 557 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.59 
 
 		 538 aa  350  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 541 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.99 
 
 		 557 aa  339  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  40 
 
 		 549 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 572 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  35.16 
 
 		 584 aa  310  4e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.35 
 
 		 562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  36.64 
 
 		 563 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.26 
 
 		 613 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  53.56 
 
 		 563 aa  295  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  48.36 
 
 		 303 aa  290  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 562 aa  282  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.5 
 
 		 589 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.38 
 
 		 580 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  34.73 
 
 		 540 aa  260  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.9 
 
 		 536 aa  258  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  44.76 
 
 		 563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  47.47 
 
 		 257 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  43.99 
 
 		 291 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  44.94 
 
 		 291 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  33.92 
 
 		 570 aa  231  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  39.67 
 
 		 505 aa  228  3e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.94 
 
 		 564 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.03 
 
 		 532 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.4 
 
 		 562 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.76 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.58 
 
 		 536 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.58 
 
 		 536 aa  210  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  40.6 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  36.41 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  37.92 
 
 		 281 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  42.32 
 
 		 291 aa  196  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  40.82 
 
 		 271 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  38.51 
 
 		 314 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  40.42 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  41.25 
 
 		 393 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  39.06 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  39.06 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  39.06 
 
 		 302 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  39.06 
 
 		 302 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.23 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  38.75 
 
 		 309 aa  191  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  41.98 
 
 		 308 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  35.22 
 
 		 302 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  38.41 
 
 		 309 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  38.06 
 
 		 310 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  36.56 
 
 		 371 aa  188  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  40.42 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  36.77 
 
 		 302 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  37.46 
 
 		 310 aa  187  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  37.58 
 
 		 300 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  37.79 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  36.84 
 
 		 387 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  38.26 
 
 		 301 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.83 
 
 		 372 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  38.26 
 
 		 302 aa  183  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  32.97 
 
 		 354 aa  183  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  33.63 
 
 		 422 aa  183  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  40.84 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  36.78 
 
 		 346 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.42 
 
 		 372 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  33.82 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  33.71 
 
 		 284 aa  181  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  35.55 
 
 		 300 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  39.31 
 
 		 296 aa  179  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  38.46 
 
 		 498 aa  178  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  35.82 
 
 		 267 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.02 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  42.35 
 
 		 304 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  38.55 
 
 		 388 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  37.69 
 
 		 267 aa  177  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  37.95 
 
 		 302 aa  176  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  36.09 
 
 		 266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  34.21 
 
 		 266 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  38.35 
 
 		 275 aa  173  7.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  34.7 
 
 		 266 aa  173  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  36.12 
 
 		 300 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  37.19 
 
 		 349 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  39.06 
 
 		 281 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.03 
 
 		 364 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  34.33 
 
 		 266 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  36.8 
 
 		 439 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  36.47 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  36.95 
 
 		 334 aa  170  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>