256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1148 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  100 
 
 		 563 aa  1153    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  41.24 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.83 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.83 
 
 		 558 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.65 
 
 		 589 aa  351  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.25 
 
 		 557 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 562 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.27 
 
 		 562 aa  340  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.92 
 
 		 559 aa  339  7e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.07 
 
 		 557 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.07 
 
 		 557 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.43 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  36.88 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.81 
 
 		 557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.61 
 
 		 538 aa  333  6e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.91 
 
 		 562 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  39.4 
 
 		 554 aa  332  9e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.05 
 
 		 580 aa  332  1e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 		 562 aa  327  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.4 
 
 		 587 aa  320  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.24 
 
 		 613 aa  317  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  37.23 
 
 		 541 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  37.41 
 
 		 538 aa  307  4.0000000000000004e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  52.05 
 
 		 577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.25 
 
 		 568 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  37.5 
 
 		 529 aa  299  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.68 
 
 		 562 aa  295  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  50.88 
 
 		 563 aa  289  9e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  38.81 
 
 		 570 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  49.16 
 
 		 303 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  47.83 
 
 		 563 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 564 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.94 
 
 		 536 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  34.12 
 
 		 540 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  33.16 
 
 		 519 aa  256  8e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.67 
 
 		 536 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.65 
 
 		 556 aa  246  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.75 
 
 		 536 aa  242  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  44.63 
 
 		 505 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.6 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  46.84 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  46.84 
 
 		 291 aa  229  9e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  53.51 
 
 		 257 aa  228  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  36.97 
 
 		 422 aa  213  7e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  45.35 
 
 		 271 aa  213  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  41.8 
 
 		 392 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.82 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.78 
 
 		 372 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  37.47 
 
 		 381 aa  205  2e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  40.49 
 
 		 831 aa  203  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  40.53 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  41.04 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  39.16 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.61 
 
 		 395 aa  200  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  40.15 
 
 		 267 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  43.6 
 
 		 291 aa  196  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  37.88 
 
 		 267 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  36.76 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  38.79 
 
 		 308 aa  194  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  38.68 
 
 		 387 aa  193  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  35.69 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  41.04 
 
 		 334 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  39.16 
 
 		 368 aa  192  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  39.8 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  37.41 
 
 		 266 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.62 
 
 		 395 aa  190  5e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  40.67 
 
 		 498 aa  190  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  37.74 
 
 		 341 aa  188  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  35.67 
 
 		 388 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  36.79 
 
 		 357 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  39.21 
 
 		 388 aa  187  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  42.86 
 
 		 314 aa  186  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  37.64 
 
 		 338 aa  186  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.78 
 
 		 364 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  40.98 
 
 		 302 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.36 
 
 		 353 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  38.91 
 
 		 437 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  36.53 
 
 		 266 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  39.54 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  36.53 
 
 		 266 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  39.58 
 
 		 300 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  36.2 
 
 		 284 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  37.87 
 
 		 300 aa  183  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  37.93 
 
 		 371 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  43.43 
 
 		 302 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  37.5 
 
 		 281 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.93 
 
 		 346 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  36.89 
 
 		 310 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  40.52 
 
 		 275 aa  179  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  39.71 
 
 		 302 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  39.71 
 
 		 302 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  36.12 
 
 		 354 aa  178  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  39.71 
 
 		 302 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  39.71 
 
 		 302 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  34.22 
 
 		 349 aa  178  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  36.84 
 
 		 282 aa  177  3e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  38.49 
 
 		 302 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  42.53 
 
 		 300 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  37.13 
 
 		 266 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>