232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2575 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  100 
 
 
291 aa  590  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  95.88 
 
 
291 aa  571  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.46 
 
 
536 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  64.79 
 
 
540 aa  351  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  64.45 
 
 
562 aa  346  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  63.16 
 
 
536 aa  341  8e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  61.19 
 
 
532 aa  338  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  62.55 
 
 
536 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.91 
 
 
564 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  49.82 
 
 
577 aa  263  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.82 
 
 
580 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  54.58 
 
 
271 aa  261  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.9 
 
 
558 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.8 
 
 
568 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.94 
 
 
562 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.56 
 
 
587 aa  249  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  49.08 
 
 
563 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.74 
 
 
538 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.28 
 
 
613 aa  247  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.81 
 
 
562 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.11 
 
 
557 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.44 
 
 
541 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.11 
 
 
557 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.11 
 
 
557 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.11 
 
 
557 aa  244  9e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.07 
 
 
572 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  50.74 
 
 
559 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  49.81 
 
 
554 aa  240  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.81 
 
 
562 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.81 
 
 
562 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.81 
 
 
562 aa  240  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.34 
 
 
589 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.49 
 
 
395 aa  238  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.42 
 
 
557 aa  237  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  43.99 
 
 
538 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  42.28 
 
 
385 aa  235  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  48.6 
 
 
549 aa  235  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  44.12 
 
 
303 aa  234  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  43.12 
 
 
422 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  43.23 
 
 
392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.78 
 
 
372 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.78 
 
 
372 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  45.25 
 
 
519 aa  231  9e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  46.84 
 
 
563 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  43.82 
 
 
541 aa  229  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  41.4 
 
 
584 aa  226  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  47.19 
 
 
529 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  49.08 
 
 
556 aa  222  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  40.36 
 
 
498 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  43.98 
 
 
393 aa  222  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  46.27 
 
 
395 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  42.18 
 
 
563 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  38.24 
 
 
390 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  40.96 
 
 
388 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  41.47 
 
 
388 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  43.23 
 
 
387 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  43.92 
 
 
439 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  41.05 
 
 
505 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  51.22 
 
 
570 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  41.83 
 
 
371 aa  206  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  40.48 
 
 
341 aa  204  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  39.13 
 
 
349 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  40.08 
 
 
368 aa  202  8e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.16 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.97 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  40.6 
 
 
427 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  41.95 
 
 
267 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  40.69 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  39 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  45.56 
 
 
300 aa  195  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.34 
 
 
364 aa  195  8.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  39.33 
 
 
358 aa  195  9e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  39.93 
 
 
267 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  41.61 
 
 
296 aa  194  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  41.07 
 
 
279 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  38.04 
 
 
831 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  45.56 
 
 
300 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  43.15 
 
 
310 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  39.36 
 
 
368 aa  191  2e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  42.74 
 
 
309 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  39.7 
 
 
284 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  42.74 
 
 
310 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  44 
 
 
302 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  44 
 
 
302 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  44 
 
 
302 aa  188  7e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  44 
 
 
302 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  43.15 
 
 
302 aa  188  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  37.82 
 
 
318 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  39.33 
 
 
266 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  38.06 
 
 
266 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  43.03 
 
 
308 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  43.8 
 
 
300 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  42.34 
 
 
309 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  40.6 
 
 
314 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  39.22 
 
 
459 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  42.75 
 
 
381 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  45.78 
 
 
257 aa  185  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  41.8 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  36.33 
 
 
338 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  35.71 
 
 
414 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>