242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2499 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 562 aa  1129    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  69.84 
 
 		 563 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  68.77 
 
 		 577 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  70.21 
 
 		 589 aa  403  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 580 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  68.84 
 
 		 568 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  74.63 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  42.78 
 
 		 549 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.07 
 
 		 562 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  38.13 
 
 		 563 aa  349  6e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.09 
 
 		 562 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.43 
 
 		 562 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.57 
 
 		 562 aa  323  6e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.09 
 
 		 558 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.35 
 
 		 557 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.13 
 
 		 557 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.13 
 
 		 557 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.41 
 
 		 557 aa  319  9e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  35.02 
 
 		 584 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.85 
 
 		 559 aa  318  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  38.07 
 
 		 554 aa  317  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  34.4 
 
 		 541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.05 
 
 		 538 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 538 aa  289  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.91 
 
 		 587 aa  287  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.97 
 
 		 572 aa  286  5e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  50.35 
 
 		 563 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 		 541 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  39.23 
 
 		 570 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  51.07 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  45.54 
 
 		 303 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  35.3 
 
 		 529 aa  263  4e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.66 
 
 		 564 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  34 
 
 		 540 aa  261  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.59 
 
 		 536 aa  261  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.68 
 
 		 562 aa  259  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.62 
 
 		 519 aa  259  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.4 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 		 536 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  47.79 
 
 		 271 aa  252  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  44.81 
 
 		 385 aa  250  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  44.53 
 
 		 392 aa  250  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  47.97 
 
 		 291 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  49.81 
 
 		 291 aa  248  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.43 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.43 
 
 		 372 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  43.35 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  44.36 
 
 		 393 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  42.81 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.09 
 
 		 532 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.82 
 
 		 395 aa  233  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  45.17 
 
 		 387 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  42.22 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  47.78 
 
 		 381 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  41.12 
 
 		 422 aa  223  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  42.22 
 
 		 388 aa  223  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  37.79 
 
 		 439 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  42.86 
 
 		 395 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  40.57 
 
 		 498 aa  216  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  43.33 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  42.24 
 
 		 831 aa  215  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  35.45 
 
 		 334 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  44.49 
 
 		 300 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  41.11 
 
 		 427 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.89 
 
 		 353 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  38.41 
 
 		 368 aa  210  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  37.78 
 
 		 302 aa  208  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  40.63 
 
 		 437 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  42.29 
 
 		 371 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  41.18 
 
 		 364 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  38.89 
 
 		 341 aa  206  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  42.38 
 
 		 300 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  42.24 
 
 		 302 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  42.24 
 
 		 302 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  42.24 
 
 		 302 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  42.24 
 
 		 302 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  40.86 
 
 		 284 aa  202  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  37.36 
 
 		 357 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  41.18 
 
 		 266 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  37.82 
 
 		 358 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  39.42 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  40.81 
 
 		 266 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  41.7 
 
 		 308 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  33.06 
 
 		 459 aa  199  7.999999999999999e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  36.53 
 
 		 346 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  38.1 
 
 		 302 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  38.75 
 
 		 266 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  44.87 
 
 		 257 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  43.38 
 
 		 275 aa  196  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  39.61 
 
 		 368 aa  196  9e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  42.54 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  36.25 
 
 		 447 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  40.19 
 
 		 301 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  38.66 
 
 		 281 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  40.81 
 
 		 310 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  40.57 
 
 		 309 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  39.19 
 
 		 389 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  37.42 
 
 		 304 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  40.21 
 
 		 309 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>