210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0741 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  98.87 
 
 		 266 aa  534  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  73.86 
 
 		 266 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  71.1 
 
 		 267 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  68.73 
 
 		 267 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  67.8 
 
 		 266 aa  375  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  50.79 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2919  general secretion pathway protein-related protein  50.79 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00976352  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  49.6 
 
 		 274 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.33 
 
 		 562 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  40.66 
 
 		 563 aa  192  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  38.2 
 
 		 358 aa  189  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.41 
 
 		 558 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.29 
 
 		 577 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.09 
 
 		 568 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.29 
 
 		 580 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  38.97 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.26 
 
 		 613 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  36.53 
 
 		 563 aa  184  9e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.22 
 
 		 562 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 589 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 587 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  39.55 
 
 		 291 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.58 
 
 		 536 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  37.08 
 
 		 392 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  37.22 
 
 		 357 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 572 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.26 
 
 		 541 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  39.78 
 
 		 554 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  38.81 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  37.83 
 
 		 346 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 562 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 562 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 562 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  35.96 
 
 		 584 aa  179  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  37.64 
 
 		 540 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  37.93 
 
 		 563 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.37 
 
 		 559 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  39.26 
 
 		 519 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  37.13 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.66 
 
 		 557 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  34.59 
 
 		 390 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 557 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  36.8 
 
 		 549 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  37.73 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 557 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 557 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 557 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  38.76 
 
 		 271 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  38.29 
 
 		 831 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.78 
 
 		 538 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  37.69 
 
 		 385 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  38.01 
 
 		 389 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0652  general secretion pathway protein-related protein  39.33 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.116587  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  40.38 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  39.33 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  39.33 
 
 		 306 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  33.21 
 
 		 541 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  34.33 
 
 		 538 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.96 
 
 		 372 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  34.96 
 
 		 372 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.34 
 
 		 562 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  37.59 
 
 		 387 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  37.22 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0697  general secretion pathway protein-related protein  38.2 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  37.22 
 
 		 395 aa  168  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  36.09 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.45 
 
 		 536 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.44 
 
 		 532 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.63 
 
 		 536 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  36.57 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.96 
 
 		 364 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  34.7 
 
 		 368 aa  163  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 556 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  39.2 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  38.87 
 
 		 529 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  35.47 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  37.36 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  35.98 
 
 		 310 aa  158  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  38.43 
 
 		 570 aa  158  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.66 
 
 		 353 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  36.4 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  36.23 
 
 		 308 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  37.36 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  37.36 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  37.36 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1303  type II secretory pathway ATPase ExeA  33.33 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  36.43 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  36.4 
 
 		 532 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  34.07 
 
 		 505 aa  156  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.19 
 
 		 564 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  34.73 
 
 		 388 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.1 
 
 		 395 aa  155  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  34.35 
 
 		 388 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  36.29 
 
 		 349 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  34.88 
 
 		 314 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  35.19 
 
 		 318 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  35.23 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  35.21 
 
 		 284 aa  154  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  35.07 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>