241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0390 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  100 
 
 		 301 aa  610  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  77.62 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  78.68 
 
 		 309 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  78.31 
 
 		 309 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  75.34 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  74.23 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  74.23 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  74.23 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  75.81 
 
 		 310 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  75.6 
 
 		 302 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  72.04 
 
 		 302 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  74.23 
 
 		 302 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  72.98 
 
 		 308 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  70.85 
 
 		 300 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  72.59 
 
 		 314 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  66.21 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  58.67 
 
 		 300 aa  356  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  57.99 
 
 		 302 aa  351  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  56.64 
 
 		 300 aa  299  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  52.74 
 
 		 300 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  51.6 
 
 		 281 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  54.32 
 
 		 275 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  52.4 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  52.5 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  50 
 
 		 296 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  52.14 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  51.8 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03697  Type II secretory pathway, component ExeA  50.77 
 
 		 261 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002369  MSHA biogenesis protein MshM  50.77 
 
 		 261 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0765  type II secretory pathway component ATPase  51.3 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00521912  normal  0.0426164 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  45.64 
 
 		 310 aa  240  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  43.62 
 
 		 447 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  43.46 
 
 		 459 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  42.48 
 
 		 437 aa  209  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.13 
 
 		 562 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1342  MSHA biogenesis protein MshM  40.46 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.577962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.28 
 
 		 536 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  40.26 
 
 		 563 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.07 
 
 		 541 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.19 
 
 		 536 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.19 
 
 		 536 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.23 
 
 		 558 aa  195  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  40.59 
 
 		 519 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 538 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.64 
 
 		 580 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.48 
 
 		 562 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.34 
 
 		 577 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  38.97 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 568 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.98 
 
 		 572 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  39.8 
 
 		 563 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.46 
 
 		 589 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  35.96 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.86 
 
 		 587 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  42.19 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  41.88 
 
 		 540 aa  189  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  39.08 
 
 		 584 aa  188  8e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.58 
 
 		 562 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  37.69 
 
 		 368 aa  187  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  44.66 
 
 		 549 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 559 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.33 
 
 		 557 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.09 
 
 		 613 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  41.97 
 
 		 563 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.73 
 
 		 564 aa  185  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  40.51 
 
 		 529 aa  185  9e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  41.8 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  39.33 
 
 		 554 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  38.26 
 
 		 538 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 562 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 562 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 562 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 557 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  42.75 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  36.58 
 
 		 422 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.72 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.72 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.72 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.07 
 
 		 532 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  37.17 
 
 		 541 aa  178  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  38.2 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  36.23 
 
 		 390 aa  170  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  36.75 
 
 		 498 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.49 
 
 		 556 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  38.21 
 
 		 387 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  37.36 
 
 		 393 aa  165  8e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  37.04 
 
 		 357 aa  165  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  37.41 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  34.57 
 
 		 368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  35.82 
 
 		 392 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  35.69 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  39.33 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.91 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  34.9 
 
 		 388 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  40.08 
 
 		 267 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  34.9 
 
 		 388 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  47.52 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.43 
 
 		 364 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.58 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  44.14 
 
 		 570 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>