235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2219 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  100 
 
 
395 aa  807    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  51.15 
 
 
387 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  49.46 
 
 
390 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  47.07 
 
 
395 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  51.21 
 
 
393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  49.11 
 
 
439 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  49.2 
 
 
392 aa  347  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  57.79 
 
 
372 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  60.07 
 
 
372 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  43.54 
 
 
385 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  46.59 
 
 
540 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  44.49 
 
 
291 aa  238  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  44.49 
 
 
291 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.88 
 
 
532 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.82 
 
 
562 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.74 
 
 
536 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  41.32 
 
 
341 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.15 
 
 
564 aa  230  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.88 
 
 
562 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  41.9 
 
 
281 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  41.11 
 
 
563 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  42.55 
 
 
427 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  41.73 
 
 
358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  39.79 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  46.62 
 
 
381 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.53 
 
 
536 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  43.28 
 
 
536 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  38.51 
 
 
364 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  46.96 
 
 
271 aa  216  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  36.76 
 
 
371 aa  216  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.66 
 
 
577 aa  215  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  48.21 
 
 
549 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  39.73 
 
 
831 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.57 
 
 
580 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.02 
 
 
558 aa  213  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  40.59 
 
 
334 aa  212  9e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.65 
 
 
568 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.98 
 
 
353 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  39.34 
 
 
284 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  37.92 
 
 
388 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  39.65 
 
 
414 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  37.73 
 
 
388 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  37.55 
 
 
346 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  41.09 
 
 
354 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  34.54 
 
 
357 aa  203  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  40.3 
 
 
498 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  40.22 
 
 
349 aa  202  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.82 
 
 
538 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.26 
 
 
587 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.01 
 
 
541 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  38.83 
 
 
422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.21 
 
 
613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  42.29 
 
 
303 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  40.61 
 
 
563 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.62 
 
 
572 aa  200  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.78 
 
 
562 aa  200  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.04 
 
 
589 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  41.24 
 
 
554 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.53 
 
 
562 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  41.58 
 
 
557 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  39.72 
 
 
532 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  37.77 
 
 
422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.58 
 
 
557 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.58 
 
 
557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.07 
 
 
557 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.24 
 
 
562 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.11 
 
 
562 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.41 
 
 
557 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  35.67 
 
 
338 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  37.07 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  37.97 
 
 
541 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.61 
 
 
559 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  39.06 
 
 
584 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  37.23 
 
 
538 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  40.64 
 
 
529 aa  189  7e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.49 
 
 
556 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  40.96 
 
 
563 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  38.62 
 
 
519 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  39.69 
 
 
267 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  46.96 
 
 
570 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  38.17 
 
 
267 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  40.16 
 
 
341 aa  184  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  37.86 
 
 
459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  37.45 
 
 
266 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  38.85 
 
 
740 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  38.55 
 
 
266 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  37.55 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  37.45 
 
 
505 aa  168  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  41.13 
 
 
281 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  38.87 
 
 
296 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  37.22 
 
 
266 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  36.84 
 
 
266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  34.17 
 
 
320 aa  167  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  38.43 
 
 
318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  38.71 
 
 
300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  36.96 
 
 
447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  37.74 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  37.68 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  38.49 
 
 
279 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2827  general secretion pathway protein-related protein  40 
 
 
274 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>