235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1217 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 		 536 aa  1086    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  94.78 
 
 		 536 aa  982    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.3 
 
 		 562 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  56.56 
 
 		 540 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.92 
 
 		 536 aa  433  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  40 
 
 		 564 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  62.55 
 
 		 291 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  62.92 
 
 		 291 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  59.18 
 
 		 532 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 538 aa  269  8.999999999999999e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 		 558 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  35.5 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.86 
 
 		 572 aa  259  8e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.89 
 
 		 541 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.98 
 
 		 587 aa  256  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  47.57 
 
 		 271 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.59 
 
 		 562 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 557 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.75 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.93 
 
 		 557 aa  250  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.27 
 
 		 562 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 562 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  33.58 
 
 		 554 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  43.75 
 
 		 563 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 557 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.85 
 
 		 559 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.64 
 
 		 613 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  45.69 
 
 		 577 aa  242  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  45.69 
 
 		 580 aa  242  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  46.39 
 
 		 303 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.37 
 
 		 557 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.57 
 
 		 562 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.68 
 
 		 562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  44.57 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  39.16 
 
 		 584 aa  233  7.000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  32.31 
 
 		 541 aa  230  6e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  31.63 
 
 		 519 aa  229  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  43.3 
 
 		 422 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  33.4 
 
 		 529 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.57 
 
 		 372 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  44.57 
 
 		 372 aa  226  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.12 
 
 		 568 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.29 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  41.77 
 
 		 563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  42.07 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  43.66 
 
 		 395 aa  219  7e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  31.86 
 
 		 538 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  50.79 
 
 		 570 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  42.32 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  47.57 
 
 		 302 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0485  MSHA biogenesis protein MshM  45.09 
 
 		 302 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3834  MSHA biogenesis protein MshM  45.09 
 
 		 302 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.319406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0506  MSHA biogenesis protein MshM  45.09 
 
 		 302 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  40.86 
 
 		 388 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  43.07 
 
 		 393 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  40.08 
 
 		 388 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0509  MSHA biogenesis protein MshM  44.73 
 
 		 302 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  41.67 
 
 		 310 aa  212  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  41.64 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  42.33 
 
 		 308 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  36.24 
 
 		 364 aa  207  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  42.47 
 
 		 387 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  41.2 
 
 		 304 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  43.17 
 
 		 310 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  43.82 
 
 		 309 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  41.22 
 
 		 395 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  38.85 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  43.45 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  43.45 
 
 		 302 aa  200  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.25 
 
 		 556 aa  200  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.786314  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  38.1 
 
 		 334 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  42.7 
 
 		 314 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  44.19 
 
 		 301 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  38.36 
 
 		 831 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  39.34 
 
 		 302 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  43.82 
 
 		 279 aa  196  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  41.02 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  42.42 
 
 		 300 aa  195  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  40.32 
 
 		 368 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  41.57 
 
 		 296 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  35.26 
 
 		 505 aa  194  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  41.24 
 
 		 291 aa  193  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  43.28 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  37.13 
 
 		 371 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  43.07 
 
 		 281 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  37.31 
 
 		 341 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  40.82 
 
 		 300 aa  187  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03091  putative ATPase and membrane protein  49.03 
 
 		 257 aa  186  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  41.53 
 
 		 302 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  40.75 
 
 		 300 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.48 
 
 		 353 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  38.28 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  39.13 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3331  general secretion pathway protein, ATPase  39.38 
 
 		 310 aa  182  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0818579  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  38.72 
 
 		 308 aa  182  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  38.84 
 
 		 346 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  40.98 
 
 		 282 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  37.6 
 
 		 358 aa  181  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  39.08 
 
 		 267 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  40.3 
 
 		 284 aa  180  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>