235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4035 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  100 
 
 		 532 aa  1041    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  61.82 
 
 		 414 aa  350  4e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  56.94 
 
 		 422 aa  327  4.0000000000000003e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  52.28 
 
 		 341 aa  282  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  52.04 
 
 		 368 aa  282  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2016  ATPase  48.28 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  50.38 
 
 		 358 aa  272  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  48.04 
 
 		 353 aa  262  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  49.25 
 
 		 334 aa  257  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  47.35 
 
 		 831 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  49.26 
 
 		 371 aa  250  5e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  43.26 
 
 		 357 aa  247  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  48.11 
 
 		 364 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  49.81 
 
 		 349 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  44.7 
 
 		 346 aa  239  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  43.55 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  45.85 
 
 		 341 aa  223  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  41.39 
 
 		 308 aa  213  7e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  40 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  41.98 
 
 		 392 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  36.4 
 
 		 385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  38.38 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  39.72 
 
 		 395 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  36.23 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.79 
 
 		 589 aa  190  7e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  39.92 
 
 		 271 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.15 
 
 		 372 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  42.62 
 
 		 577 aa  186  9e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.07 
 
 		 568 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.63 
 
 		 580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  40.15 
 
 		 372 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.46 
 
 		 562 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  37.59 
 
 		 563 aa  183  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.11 
 
 		 562 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.11 
 
 		 562 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  37.74 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  40.56 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.11 
 
 		 558 aa  179  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.74 
 
 		 557 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.25 
 
 		 557 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.74 
 
 		 557 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 562 aa  176  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  40.91 
 
 		 549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  36.06 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  40.38 
 
 		 354 aa  174  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.08 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  34.97 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.7 
 
 		 541 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  38.35 
 
 		 284 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.36 
 
 		 559 aa  172  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.07 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.67 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  42.5 
 
 		 300 aa  169  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  35.87 
 
 		 395 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  33.58 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 538 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  38.91 
 
 		 439 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.14 
 
 		 532 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2575  AAA ATPase  37.65 
 
 		 291 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  34.89 
 
 		 281 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.98 
 
 		 564 aa  164  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  35.45 
 
 		 291 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  36.54 
 
 		 563 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  38.17 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.44 
 
 		 562 aa  160  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.18 
 
 		 562 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  37.74 
 
 		 267 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  34.29 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  38.68 
 
 		 291 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  33.47 
 
 		 422 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  35.34 
 
 		 302 aa  158  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  31.99 
 
 		 388 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  40.42 
 
 		 300 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  36.18 
 
 		 563 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  38.65 
 
 		 275 aa  155  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  40.82 
 
 		 281 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  35.61 
 
 		 267 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  36.4 
 
 		 266 aa  154  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  36.03 
 
 		 266 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  35.66 
 
 		 437 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  35.83 
 
 		 302 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  31.48 
 
 		 388 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  33.99 
 
 		 584 aa  150  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3346  MSHA biogenesis protein MshM  35.92 
 
 		 304 aa  150  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.158291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.58 
 
 		 536 aa  150  7e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  32.44 
 
 		 740 aa  149  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.84 
 
 		 536 aa  150  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1136  MSHA biogenesis protein MshM  36.6 
 
 		 296 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  37.69 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4416  MSHA biogenesis protein MshM  37.55 
 
 		 302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.620402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  34.02 
 
 		 368 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  34.85 
 
 		 266 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  38.55 
 
 		 308 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3767  MSHA biogenesis protein MshM  37.16 
 
 		 302 aa  147  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  34.29 
 
 		 541 aa  147  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  39.18 
 
 		 279 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0545  MSHA biogenesis protein MshM  38.17 
 
 		 302 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>