43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3413 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 783 aa  1621    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 		 791 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.85 
 
 		 1213 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  24.79 
 
 		 471 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.11 
 
 		 1208 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.28 
 
 		 1188 aa  99.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  23.8 
 
 		 566 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  32.82 
 
 		 460 aa  89.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.23 
 
 		 1193 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  23.16 
 
 		 477 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  34.87 
 
 		 1188 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1209 aa  71.2  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  22.87 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  21.65 
 
 		 462 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  34.04 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.26 
 
 		 782 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  23.12 
 
 		 482 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  28.83 
 
 		 303 aa  55.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  22.44 
 
 		 1221 aa  54.7  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.81 
 
 		 837 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  25.09 
 
 		 594 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  25 
 
 		 740 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1190 aa  52.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 		 1186 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  23.72 
 
 		 396 aa  50.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.61 
 
 		 957 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1313 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1196 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 		 343 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  24.58 
 
 		 985 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 1060 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  20.09 
 
 		 1101 aa  48.1  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 438 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  20.73 
 
 		 1063 aa  47.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  24.58 
 
 		 457 aa  47.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  23.26 
 
 		 470 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  21.65 
 
 		 438 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  22.56 
 
 		 492 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  20.97 
 
 		 1411 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  29.79 
 
 		 816 aa  46.2  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  20 
 
 		 828 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  29.61 
 
 		 741 aa  44.3  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  27.19 
 
 		 928 aa  44.3  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>