59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4878 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  936    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  52.48 
 
 
450 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  59.58 
 
 
384 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  50.15 
 
 
475 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  51.37 
 
 
547 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  42.06 
 
 
648 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  46.96 
 
 
627 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  41.39 
 
 
470 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  48.19 
 
 
466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  47.89 
 
 
662 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  47.72 
 
 
638 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 
877 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  51.22 
 
 
456 aa  319  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  48.8 
 
 
456 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  48.8 
 
 
456 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  44.13 
 
 
456 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  43.85 
 
 
456 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  44.07 
 
 
537 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  44.24 
 
 
446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  41.8 
 
 
623 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  44.28 
 
 
520 aa  273  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  43.56 
 
 
405 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  38.6 
 
 
534 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  35.64 
 
 
491 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  35.45 
 
 
438 aa  199  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  31.07 
 
 
511 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  25.41 
 
 
500 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 
1932 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  26.88 
 
 
1914 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  41 
 
 
117 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.86 
 
 
1209 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 
1908 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 
1213 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  25 
 
 
781 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  24.36 
 
 
902 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  24.36 
 
 
902 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  31.53 
 
 
1188 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.41 
 
 
1163 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
335 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.89 
 
 
1161 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.89 
 
 
1161 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.88 
 
 
1367 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  39.13 
 
 
303 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  24.03 
 
 
891 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  23.14 
 
 
2077 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  38.1 
 
 
566 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.18 
 
 
1477 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 
1214 aa  51.6  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  27.78 
 
 
129 aa  50.4  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  26.25 
 
 
513 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  24.16 
 
 
471 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.64 
 
 
1176 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  21.07 
 
 
1164 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
783 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  23.08 
 
 
477 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.75 
 
 
1193 aa  46.6  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.58 
 
 
1190 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  29.76 
 
 
460 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  27.86 
 
 
947 aa  43.1  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>