59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1512 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  100 
 
 		 638 aa  1310    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  37.54 
 
 		 623 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 877 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  34.29 
 
 		 627 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  45.51 
 
 		 446 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  52.27 
 
 		 547 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  47.72 
 
 		 457 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  45.33 
 
 		 537 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  35.77 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  46.39 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  45.95 
 
 		 450 aa  313  7.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  44.71 
 
 		 662 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  44.44 
 
 		 466 aa  307  4.0000000000000004e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  41.47 
 
 		 475 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  44.41 
 
 		 648 aa  303  9e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  44.05 
 
 		 456 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  44.05 
 
 		 456 aa  299  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  43.35 
 
 		 456 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  44.75 
 
 		 405 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  42.2 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  42.2 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  44.89 
 
 		 470 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  39.37 
 
 		 534 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  34.49 
 
 		 491 aa  248  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  35.82 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  32.29 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  25.85 
 
 		 500 aa  167  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  32.93 
 
 		 1188 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  40.4 
 
 		 117 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 		 1213 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  23.63 
 
 		 902 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  23.63 
 
 		 902 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  40.7 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  41.86 
 
 		 464 aa  67  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 		 1908 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  21.33 
 
 		 1914 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  41.18 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  34.04 
 
 		 783 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  37.78 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1477 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  40.91 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  34.29 
 
 		 1188 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  35.29 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  38.64 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  20.39 
 
 		 781 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 791 aa  54.3  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  21.34 
 
 		 1932 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 335 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  39.71 
 
 		 1193 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  20.16 
 
 		 891 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  21.77 
 
 		 2077 aa  51.6  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  29.46 
 
 		 129 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  22.86 
 
 		 1209 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  32.94 
 
 		 566 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 		 740 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  18.08 
 
 		 1367 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.9 
 
 		 1163 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  18.36 
 
 		 1214 aa  44.7  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1177 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>