56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1168 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  100 
 
 		 520 aa  1079    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  48.82 
 
 		 877 aa  512  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  46.2 
 
 		 627 aa  461  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  36.42 
 
 		 623 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  35.77 
 
 		 638 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  44.19 
 
 		 537 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  44.35 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  46.27 
 
 		 547 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  46.22 
 
 		 648 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  42.5 
 
 		 534 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  41.93 
 
 		 384 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  44.28 
 
 		 457 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  40.93 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  40.93 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  41.95 
 
 		 456 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  42.39 
 
 		 456 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  40.12 
 
 		 475 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  42.09 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 		 662 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  39.7 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  40.56 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  40.18 
 
 		 450 aa  252  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  37.64 
 
 		 491 aa  249  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  38.18 
 
 		 470 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  32.95 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  37.8 
 
 		 438 aa  213  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  34.35 
 
 		 511 aa  177  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  46.6 
 
 		 117 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 		 1209 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  22.81 
 
 		 902 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  22.81 
 
 		 902 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  23.65 
 
 		 1908 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  24.11 
 
 		 1914 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  23.05 
 
 		 781 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  20.68 
 
 		 1214 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.39 
 
 		 1932 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  21.25 
 
 		 1190 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  19.24 
 
 		 1367 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.47 
 
 		 1161 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.47 
 
 		 1161 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.38 
 
 		 1163 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 335 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  21.31 
 
 		 891 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  22.02 
 
 		 2077 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  22.97 
 
 		 787 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1177 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  32.43 
 
 		 129 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.21 
 
 		 1176 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  31.97 
 
 		 1348 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.6 
 
 		 1477 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  20.67 
 
 		 1164 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  23.2 
 
 		 376 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  31.36 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  33.71 
 
 		 1363 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1847  hypothetical protein  23.46 
 
 		 870 aa  47  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.277811  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  32.53 
 
 		 1656 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>