54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1625 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  964    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  59.53 
 
 
475 aa  578  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5745  hypothetical protein  50.3 
 
 
384 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  41.28 
 
 
446 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  48.19 
 
 
457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  46.27 
 
 
547 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1449  hypothetical protein  40.88 
 
 
456 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1420  hypothetical protein  40.88 
 
 
456 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  46.38 
 
 
662 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  47.63 
 
 
877 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  43.05 
 
 
627 aa  317  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3861  hypothetical protein  43.07 
 
 
450 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.124994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  45.56 
 
 
648 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  44.44 
 
 
638 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  40 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3808  hypothetical protein  43.68 
 
 
456 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  41.88 
 
 
537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2158  hypothetical protein  41.9 
 
 
456 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2114  hypothetical protein  41.9 
 
 
456 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  43.79 
 
 
470 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3077  toll-interleukin receptor  42.69 
 
 
623 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.783629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0813  hypothetical protein  33.54 
 
 
491 aa  271  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  39.7 
 
 
520 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4814  hypothetical protein  40.57 
 
 
534 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.592191  normal  0.650141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0227  hypothetical protein  37.09 
 
 
438 aa  217  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1814  hypothetical protein  31.21 
 
 
511 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  26.96 
 
 
500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1446  hypothetical protein  45.63 
 
 
117 aa  85.1  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.712743  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  25.41 
 
 
781 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.31 
 
 
1914 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  26.27 
 
 
1908 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  40.2 
 
 
1196 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  28.42 
 
 
464 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  24.63 
 
 
902 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  24.63 
 
 
902 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 
1161 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.49 
 
 
1161 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  21.33 
 
 
1214 aa  63.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  23.81 
 
 
1932 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  26.46 
 
 
2077 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.38 
 
 
1477 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 
1209 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.51 
 
 
1163 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1447  hypothetical protein  30.09 
 
 
129 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388571  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  21.13 
 
 
891 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.86 
 
 
1367 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1190 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 
1190 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.87 
 
 
1177 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 
1164 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 
335 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.08 
 
 
1176 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  21.28 
 
 
787 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  27.05 
 
 
854 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>