50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0590 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  945    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  43.61 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  38.25 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  35.88 
 
 		 464 aa  276  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  36.09 
 
 		 477 aa  272  7e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 462 aa  264  3e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  33.05 
 
 		 1188 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  32.07 
 
 		 566 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  28.63 
 
 		 1213 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  39.29 
 
 		 315 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  29.24 
 
 		 1193 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 1221 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  30.13 
 
 		 1208 aa  176  6e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  33.92 
 
 		 1190 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.92 
 
 		 1196 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  33.43 
 
 		 464 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1209 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.02 
 
 		 1188 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  34.14 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  27.93 
 
 		 396 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  25.36 
 
 		 513 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.35 
 
 		 1411 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 791 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.19 
 
 		 1247 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  21.65 
 
 		 783 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  38.64 
 
 		 638 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  26.48 
 
 		 470 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  32.74 
 
 		 840 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  40.62 
 
 		 111 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0269  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 729 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  26.03 
 
 		 990 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  28.08 
 
 		 1030 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  26.13 
 
 		 960 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  26.42 
 
 		 482 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  28.97 
 
 		 792 aa  47.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 915 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.53 
 
 		 1014 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  26.03 
 
 		 504 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  23.46 
 
 		 916 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  30.28 
 
 		 1438 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  23.4 
 
 		 946 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5275  transcriptional regulator, SARP family  28.57 
 
 		 989 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 872 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  30.12 
 
 		 740 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3097  transcriptional regulator, SARP family  24.76 
 
 		 915 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  23.74 
 
 		 922 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9294  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1003 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.705577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 910 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 1137 aa  43.5  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>