42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4055 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4055  ATPase  100 
 
 		 460 aa  928    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  45.69 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  38.25 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  42 
 
 		 471 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  39.7 
 
 		 464 aa  310  4e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  37.85 
 
 		 462 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  34.08 
 
 		 1188 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  33.64 
 
 		 566 aa  219  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  31.39 
 
 		 1193 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  31.85 
 
 		 1213 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 438 aa  210  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 1221 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  33.53 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  37.7 
 
 		 315 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.93 
 
 		 1208 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  33.52 
 
 		 1196 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  32.52 
 
 		 1209 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 1190 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  29.19 
 
 		 1188 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  28.27 
 
 		 513 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.24 
 
 		 1411 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  30.63 
 
 		 492 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 783 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.17 
 
 		 1247 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  29.21 
 
 		 791 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1512  TIR protein  37.78 
 
 		 638 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00867702 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  23.19 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  33.72 
 
 		 111 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0735  diguanylate cyclase  34.57 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  26.32 
 
 		 740 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  29.27 
 
 		 648 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  48.84 
 
 		 844 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0741  ATPase  29.63 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.112703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  25 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1010 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  26.57 
 
 		 741 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2279  NB-ARC domain protein  25.23 
 
 		 1438 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  24.23 
 
 		 504 aa  44.3  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4878  hypothetical protein  29.76 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  27.34 
 
 		 840 aa  43.5  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 802 aa  43.1  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>