159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0853 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  100 
 
 		 844 aa  1667    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.89 
 
 		 1238 aa  121  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0741  ATPase  30.7 
 
 		 362 aa  96.3  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.112703  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  25.36 
 
 		 1147 aa  93.6  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 991 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.72 
 
 		 782 aa  79.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.12 
 
 		 957 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 650 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1060 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 412 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1025 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  20.79 
 
 		 1526 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.55 
 
 		 1279 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 1266 aa  70.1  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.79 
 
 		 1261 aa  69.7  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.88 
 
 		 852 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  21.66 
 
 		 991 aa  69.3  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1101 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1432  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 621 aa  66.2  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.197546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 1285 aa  65.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  24.14 
 
 		 1204 aa  65.5  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 714 aa  65.5  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.21 
 
 		 1360 aa  65.5  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 907 aa  64.7  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  22.7 
 
 		 1180 aa  64.7  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1550 aa  64.3  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  19.84 
 
 		 1123 aa  64.3  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  19.83 
 
 		 816 aa  63.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  27.42 
 
 		 490 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 1195 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  22.5 
 
 		 718 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 		 985 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1313 aa  62  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1444  TPR repeat-containing protein  25.34 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  21.05 
 
 		 1057 aa  61.6  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0665  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.58 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.020482  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  20.93 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.31 
 
 		 2145 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 1050 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.55 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0682  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.2 
 
 		 375 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0600  tetratricopeptide domain-containing protein  27.19 
 
 		 349 aa  57.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.709522  hitchhiker  0.000000000136146 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  24.06 
 
 		 999 aa  56.6  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0979  GGDEF family protein  26.09 
 
 		 667 aa  56.6  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.44 
 
 		 609 aa  56.6  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  22.81 
 
 		 941 aa  55.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.97 
 
 		 1285 aa  55.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  21.9 
 
 		 1295 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  23.5 
 
 		 1611 aa  55.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 356 aa  55.1  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  27.47 
 
 		 934 aa  54.7  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20.45 
 
 		 1104 aa  54.7  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.45 
 
 		 1186 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.71 
 
 		 1441 aa  54.7  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 343 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 750 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1063 aa  53.9  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  25.74 
 
 		 1027 aa  54.3  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  22.62 
 
 		 825 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 791 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  23.36 
 
 		 424 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  18.22 
 
 		 755 aa  53.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2022  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 351 aa  53.5  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.372668  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1404 aa  53.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  26.32 
 
 		 1017 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  23.41 
 
 		 671 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  28.76 
 
 		 836 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 878 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  25.35 
 
 		 945 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  25.41 
 
 		 456 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 357 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  18.72 
 
 		 872 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1162 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0797  SARP family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 565 aa  51.2  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.999695  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.4 
 
 		 560 aa  51.2  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4076  histidine kinase  22.45 
 
 		 667 aa  51.2  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.249378  normal  0.142572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  24.14 
 
 		 340 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  21.38 
 
 		 834 aa  50.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  20.65 
 
 		 1134 aa  50.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 438 aa  50.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  23.32 
 
 		 1826 aa  50.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  21.39 
 
 		 992 aa  50.4  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  22.11 
 
 		 830 aa  50.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6069  signal transduction histidine kinase  21.3 
 
 		 659 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1981  transcriptional regulator, SARP family  22.1 
 
 		 1033 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0609683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3442  hypothetical protein  26.81 
 
 		 562 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.175403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.98 
 
 		 1162 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3205  hypothetical protein  26.81 
 
 		 562 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000812064 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0030  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.51 
 
 		 295 aa  50.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0305  Tetratricopeptide domain protein  24.29 
 
 		 603 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  25.85 
 
 		 950 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 949 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0305  Tetratricopeptide domain protein  24.29 
 
 		 603 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  17.67 
 
 		 1429 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  51.16 
 
 		 477 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4244  transcriptional activator domain-containing protein  23.97 
 
 		 992 aa  48.9  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0384973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  24.59 
 
 		 850 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>