135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1356 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  100 
 
 
492 aa  995    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  35.19 
 
 
1209 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  37.14 
 
 
1188 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  34.43 
 
 
1208 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  30.99 
 
 
566 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32 
 
 
1221 aa  209  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  32.33 
 
 
1213 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  36.5 
 
 
1190 aa  205  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  34.35 
 
 
1193 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  34.44 
 
 
1196 aa  196  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  35.89 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  36.93 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  35.8 
 
 
464 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  31.06 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  33.23 
 
 
460 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  33.83 
 
 
462 aa  156  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  33.44 
 
 
464 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  35 
 
 
513 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 
1188 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  29.94 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28 
 
 
1411 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  31.34 
 
 
482 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  28.24 
 
 
477 aa  130  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31 
 
 
1247 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  32.99 
 
 
315 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 
783 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  26.69 
 
 
921 aa  62.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  27.27 
 
 
483 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  22.88 
 
 
816 aa  60.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  26.65 
 
 
490 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  24.92 
 
 
418 aa  60.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
1714 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3482  ATPase-like protein  26.28 
 
 
777 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  23.58 
 
 
1058 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  24.29 
 
 
1050 aa  58.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  26.07 
 
 
993 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  27.31 
 
 
701 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1770  Tetratricopeptide TPR_4  32.69 
 
 
741 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.430666  normal  0.588831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1973  transcriptional regulator, SARP family  28.84 
 
 
1008 aa  57.4  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.458427  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  24.75 
 
 
802 aa  57  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  29.12 
 
 
1030 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  23.8 
 
 
1103 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0576  transcriptional regulator, SARP family  29.44 
 
 
946 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  26.85 
 
 
982 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  24.46 
 
 
916 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1930  transcriptional activator domain-containing protein  25.26 
 
 
991 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.816243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  24.41 
 
 
844 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  26.38 
 
 
1017 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5472  transcriptional regulator, SARP family  26.91 
 
 
994 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.959943  normal  0.441932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3056  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
1021 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  26 
 
 
907 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  31.18 
 
 
788 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2826  hypothetical protein  35.8 
 
 
111 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8120  NB-ARC domain protein  24.08 
 
 
978 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2958  transcriptional regulator, SARP family  25.74 
 
 
964 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.500488  hitchhiker  0.00113225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  27.36 
 
 
934 aa  53.9  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  26.09 
 
 
1097 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.91 
 
 
1145 aa  53.5  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  23.82 
 
 
1085 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  29.03 
 
 
804 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.73 
 
 
1004 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  25.76 
 
 
792 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  25.52 
 
 
1056 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  25.45 
 
 
1043 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  24.13 
 
 
966 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  27.11 
 
 
824 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  27.44 
 
 
776 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  28.8 
 
 
689 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  24.5 
 
 
952 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
775 aa  52  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1065  ATPase-like protein  30.91 
 
 
649 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.444255  normal  0.509031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  22.78 
 
 
882 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  22.65 
 
 
601 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 
791 aa  50.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  26.36 
 
 
1027 aa  50.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0797  transcriptional regulator, SARP family  27.43 
 
 
1001 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  24 
 
 
931 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  26.11 
 
 
812 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2954  transcriptional regulator, XRE family  29.05 
 
 
915 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 
930 aa  50.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  24.56 
 
 
1058 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4966  transcriptional regulator, SARP family  29.31 
 
 
1030 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.998552 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.59 
 
 
1131 aa  50.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  28.93 
 
 
1914 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32 
 
 
995 aa  50.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2572  transcriptional regulator, SARP family  28.91 
 
 
1011 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  22.58 
 
 
999 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  22.25 
 
 
601 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  22.25 
 
 
601 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  28.23 
 
 
757 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  27 
 
 
919 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0900  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 
908 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.836617  normal  0.151973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  29.35 
 
 
1020 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5360  transcriptional regulator, SARP family  28.73 
 
 
913 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.265987 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  22.59 
 
 
957 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  30.77 
 
 
818 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2058  transcriptional activator domain-containing protein  24.8 
 
 
630 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.366352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  22.88 
 
 
1125 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6437  NB-ARC domain protein  30.14 
 
 
715 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  24.37 
 
 
1060 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>