43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2788 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  810    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  31.13 
 
 		 438 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1356  NB-ARC  31.06 
 
 		 492 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000010026  normal  0.0147503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  30.72 
 
 		 1209 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  32.39 
 
 		 1188 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1196 aa  133  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  29.23 
 
 		 471 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0590  hypothetical protein  27.93 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.401741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  28.34 
 
 		 566 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  29.14 
 
 		 1213 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  29.32 
 
 		 1208 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4055  ATPase  27.74 
 
 		 460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.583039  normal  0.0382097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 1221 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  30.18 
 
 		 1190 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.33 
 
 		 1193 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1440  WD repeat-containing protein  25.86 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  27.07 
 
 		 513 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  23.2 
 
 		 464 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  24.92 
 
 		 462 aa  92.4  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.57 
 
 		 1188 aa  82.8  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  32.37 
 
 		 482 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.93 
 
 		 1411 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0639  WD repeat-containing protein  27.42 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.221679  decreased coverage  0.0018351 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.76 
 
 		 1247 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2780  transcriptional regulator, XRE family  26.38 
 
 		 782 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.223521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  23.6 
 
 		 483 aa  57.4  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  40.54 
 
 		 1060 aa  51.2  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3413  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 783 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.335652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 901 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2533  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 798 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.617329  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 952 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1101 aa  47  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  26.95 
 
 		 806 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  24.2 
 
 		 1136 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.93 
 
 		 678 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  23.01 
 
 		 1158 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  30.34 
 
 		 1010 aa  43.5  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3462  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 		 791 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 910 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3098  transcriptional regulator, SARP family  29.57 
 
 		 926 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 1714 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  41.07 
 
 		 1185 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>