17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2808 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2808  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  982    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2810  hypothetical protein  31.77 
 
 		 482 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0246562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4702  WD-40 repeat-containing protein  23.74 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0010  hypothetical protein  26.83 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2788  hypothetical protein  23.6 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0640991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.17 
 
 		 1208 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  25 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1209 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4804  response regulator receiver protein  25.2 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0153583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0937  WD repeat-containing protein  22.89 
 
 		 566 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.23 
 
 		 1411 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2114  WD repeat-containing protein  21.28 
 
 		 477 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485038  normal  0.942485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2292  ATPase  23.95 
 
 		 471 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3256  transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1196 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.8 
 
 		 1193 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  30.89 
 
 		 1055 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>